EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28920 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:45021170-45022034 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr23:45021878-45021891AAATTAATTAAAT+6.07
POU4F1MA0790.1chr23:45021651-45021665CATTAATAATGCAT-7.73
POU4F2MA0683.1chr23:45021649-45021665TGCATTAATAATGCAT-6.39
POU4F3MA0791.1chr23:45021649-45021665TGCATTAATAATGCAT-7.5
Enhancer Sequence
CTCTATATGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGCGG AGAAGGGCCC AACATGTTAA 60
AGGACAATCT GACGAAGCTG TTGTTGCGCG CTCTCGTGCG CGCGCGCTCC TTCGCGTGCG 120
TCTTTAGAGG TGAACGGGTG CAATGTGAAT GAATGAGATC AAGCGTTTGA CTGAGGAATC 180
ATCTGGTCTG AGTGCGTTCT GTTCACGTGC ATCGATCATT CCGATCAGTG ATCGATCAGG 240
GAATGGTGGC TGAGCGCGCG CAAGGTTATT CGGTGAGTGT CCTCCGCTCG CGCGCGCTCA 300
CGTGACGTGA CGTGATTTCG CTCATATCCG GAGCAGCATC ATCCATCAGC GGTTATATAA 360
CGATATACAG GACACACACA CACGCATATG CATCTGTCTC CACATTGATC TCCAGTGTGT 420
GTGTGTCATG AGCCCTTTGT GTGTGTCATT TAATATGTGT ACCATGTTCC AGCAGTAAGT 480
GCATTAATAA TGCATCATTA TAGTTTAATG CAGCTGTGTG TTCCAGTAAA TAACTTTTAG 540
CTGAGTCACT GACTTTAAAC AATGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 600
TTGCACAAAT GTCCTGATGT GTCTCGCTCT ATAGCAGCTT TCCTCTGATC AATCTCATAT 660
GTCCAAAGAT GTTTGGAGCA GCCTTTCAAC AATATAATCA GACACGTCAA ATTAATTAAA 720
TACGACAATA AATAATAAGA CAATAAAATC AGATATTTTT CTAATTTTCC ATCGAAACCA 780
AACAGTTAAA ACAATCTCAC AGAGAATCAC TGAAGTCATA ATGAAATCTG AGGGAACACA 840
AGCTAAATTC TGTGTCCTAT CTCT 864