EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28569 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:36023538-36024168 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr23:36023716-36023727GTTTTATGGCC-6.62
CDX2MA0465.1chr23:36023717-36023728TTTTATGGCCT-6.02
CDX4MA1473.1chr23:36023716-36023727GTTTTATGGCC-6.32
Enhancer Sequence
ATCTTGACCG AAAGGGCCAC ATTGCGAGTT ACTGTGGTTA GTATGTTGCT TTTTACACAA 60
AGCCCTCTTT TTTAGCCCTC TTGCTACGTA TTTTGAAGTT TAGAGGGTTA TTTATGCCAA 120
TTGCCCAAAG CAGGACCAGT GAGTGGTGCA GGAAGAGCAC GTGGGGTCAT TAAAGTGGGT 180
TTTATGGCCT GCAAGACCTG ACAAACCCTC AATATATTTA CATCATATAT AATGTTAACT 240
GTCCGTAATC GCAGCTGTTG GCTACTCTTA TCTCTGAGAG AACGGCTTAG AGCCTGTTAG 300
TGCGGGTTAC TCGCGTCAGG GTCTGTAGAA GTTCGACTCT CCCAAATGGA TCCCAGGCGG 360
CTGCCGTAAG TTAATAATCT TGTTTTCCTA TTTTTTAATT AAATGTACTT TCCTCAGCAA 420
CACCCTCGGG AATTAATCAA AGATGTAATT TAATAGTTCT TGGAGAAATT GTGTCAAGTG 480
GTGCGCAAAT CTGTTCTCAT CTGTTCACGT TTTCTGAGGT CCAGAACGTA GGCTTGTGCA 540
TTTGTATATA ACTGTTAATT TGGCACTCAT GTGGAATTAT TGTTCTGGCG ATAGATACAA 600
ATCGAATTCT CTATATCATG ATTCTTAAGT 630