EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28552 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:35845375-35847151 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr23:35845695-35845706AATTGTTTATT+6.02
GSX1MA0892.1chr23:35846866-35846876TTTAATTAGG-6.02
MLXMA0663.1chr23:35846890-35846900ATCACGTGAT+6.02
MLXMA0663.1chr23:35846890-35846900ATCACGTGAT-6.02
MLXIPLMA0664.1chr23:35846890-35846900ATCACGTGAT+6.02
MLXIPLMA0664.1chr23:35846890-35846900ATCACGTGAT-6.02
POU4F3MA0791.1chr23:35845450-35845466TTTATGAATAATGCAT-6.06
RARA(var.2)MA0730.1chr23:35845663-35845680AGGACATGTAAGGGTCA+6.73
Rarb(var.2)MA0858.1chr23:35845663-35845680AGGACATGTAAGGGTCA+6.04
SOX15MA1152.1chr23:35846808-35846818AAAACAATAG-6.02
TEAD1MA0090.2chr23:35845600-35845610ATGGAATGTG-6.02
TEAD4MA0809.1chr23:35845600-35845610ATGGAATGTG-6.02
Enhancer Sequence
ATGTAGACAT TATTTTCTAC ATTTAAACTT GTTACCAAAT ATCATAGGGC AACAACAGTA 60
ATTACGTTAA GTGCCTTTAT GAATAATGCA TTCATTTAAT TCGAGGGATC AGGCATTTTT 120
CAGTGCATGA AAACACAGAT CATGTGACAC CCTGTAGTCT GAAATTGCAT CCCTGGATGT 180
TGCTATTGAA TTATATTTTA GAGTGTATTA ATATAAAAGC ATACAATGGA ATGTGCAACA 240
TAGAGAGTAA TACTACTGTA TATGCTGAAT GCTGTTTGTG TTTGAATCAG GACATGTAAG 300
GGTCATTTGC TTAAGATGTT AATTGTTTAT TACTGTTGTT GTTTAGCCTT AAAACCAAAC 360
TTACTGACCA AAGTTTAAAT TCCATCTGGC CAACATGTGC TCAGAAACAA GCAGCTTTCA 420
ATTAGCCACC ACAGAAAATT CACTGACTTG AATTTAACTT GAACACAAAT TCCTATTGGA 480
ATGGCTTTAT TTTGCTTGCA AAGTTTTGTA AAACAAAGTG AGTGAACCTA CACTTTAAAA 540
ATACACTGGA GCATACTTTA AAATACAGTG TAAAAAATAA CTAACTTGAC ACACTCGGGA 600
AACAGATGTC ATGCACATTG CGAGTTCAAA AGCATTTGGC CTTTTTTATA CCTCATATAC 660
TCAGAAAGCT TGTGCATTTC TCGCTCTAAA TTGAAGAATA AGTGATTTGT TTGTAACCAT 720
GGCCGTGAAC AGAAGGCCCT ACTGTATGTG AGCTCGACCT TAAATGGGAC TGTTTGCCTC 780
TCGTCGTTCA CCCCCTCCAC CCTCGTCCCC TTTTTCTGTT TTCTATCAAA TTCCTCTTTT 840
TATGCCCCCC TTTCTTCTTT TGAAGTCTCC AAACTCTTGT AAAAGGCCAA GCTGGTGGTT 900
TTTGCTGAAC CCTGTGGTGG GACAGAGAGG GAGGGGGTGT AGGTTAAGTT TAGGCTTTCC 960
ATTGAAGGTA GCTGAAGAAG GTGGGGCAAT AAAGTTAAAG TTTTTTATTT TTATGATTGG 1020
GACTTTTTTT ACTAGCTTAG GCTACAGCTG GTGGTGTGAA TGGCTGCCCG AGGTGTTGGA 1080
GTCTTAATAA AGACCCCGCC AGCCGGGCTG GGGCCTCCAG TCCAGCCATG AGACCACCTT 1140
TATAGGCCTA GCTTACGAGC AGGGGCCTCT ATTAAAACCT AGCAGGACTG CACTGAGGAA 1200
TTTAGGGCCG GGAAACAAGA GAAAAATAGG GTTTGTGTGT CAAAGGACGG CAAGGGTGAA 1260
GGATGGGGGT TTGAATTTTG ACTGACTGAG GGTAAAAGTC AGGGCAAGTT ACCCTGACAT 1320
ATAAAGGCGC TTCTATAAAA GAGAGTTTTT ATAGAGAGCT GTGTAACAGG GCAAATAGTT 1380
GAAGCGATGC AGATATGAAA CACAGAATCT GCTTTTATGC AGTAGTAGCT CTGAAAACAA 1440
TAGTATATTT ATCAGCTTTG ATTCTAATCA GCAACTGCGA AAAATTTGCA TTTTAATTAG 1500
GGATGTCCAG ATCTGATCAC GTGATTGGAA ATCTGGCTCG ATCAGGTGGT TTCAGACTCG 1560
ATCGAAATTG GACGTTACCT CCCAATCAGG ACTCAAACAT ATAGATATTA GCACCCCTGA 1620
ATTATTAGCT TTCCTGTTTA TTTTTTCCCC CAATTTCTGT TTAACGGAGA GATGATTTTG 1680
TCTACACATT TCTAAACATA ATAGTTTTAA TAACTCGTTT CTAATAATGG ATTTATTTTA 1740
TCTTTGCCAT GATGACAGTA AATAATATTT TACTAG 1776