EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28532 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:35712918-35714178 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MNX1MA0707.1chr23:35713149-35713159GGTAATTAAA+6.02
NEUROG1MA0623.2chr23:35714143-35714153GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr23:35714143-35714153GACATATGTC-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr23:35714007-35714020ATTAAGTGGTTAC-6.28
Enhancer Sequence
GCACTAGAGT TCATCTGGAA GTGGTCTCAG TCCACTTGGT GTGCACCAGC ATTCACACTT 60
GCTCAATTCA ACCGCATTAA CAGAACTGTC AGGTTTTGAC GTGAAAGCTG AGCGGATTTT 120
TGGTCCTCTG ATCTATTCAG TCCGATTCGT TCGCCCCAGT TGGTCTAAGC TATAGTCTGT 180
TGTTTTAAAA TGCAGATAAT GCTACGGCGT AGCGTTTGTT TGTTATTTGT AGGTAATTAA 240
ATACGTAATG CATTATACAC ACGCTTACAG CGCCTTAAAG AAGGTGATGT AATTCTCCGA 300
CTGACTGGGA GAGAGTGATT GAAGTTTCTC ACGCGCTAAA AATAACGACG TCTGCACAGC 360
AACATCGCGA CGTTTCACAT CAAGTGAAAA AAGAAAAACA CGTTGACTGG TTTACTTGTA 420
TAGTCACGCG TATATTTCAA AATAAAACTT CGGCTTGTTT TATTTACATT CCCCCGCAGG 480
TTTTTCTTAT TCTCCTTTCG GGTGTTTGCA TCCTATCTAT CGCATCCTCT CCGGTCATGC 540
GCTCGGGATG AGCTGAGACA CGGTCTCACG TGTTCGCGAG CTCTCCCGCC TCTTCTCTCC 600
AATAATAGCC CTGGCATAGT GCCCCAGCCA AACTGCACAA CACCTGACCG CTGCCTCACA 660
TGGATTCCTG ACACCGTTCC TGCCCAAACT AAATCCGCAG TCTCGTGTAA ACAGCTACAA 720
CAATCGCGAG TCGCGAGCAC GGGGGCGCGC GCCGGAGGAT GCCGTGTCGG CTTAGTGATG 780
ATGCTACGGT TCCCACACAG ATGCATTTCC TGTGAGAGAG GGGCAACGAG TTGTCACGTT 840
TTGTTAGAAT GTGCCGCGTG GCTTTCAGTT TGACTTTTTA AACAACCCGA GGACACAGCC 900
GGTCAGATCG GGGCCAAGAG AATGCGATAT AAACGGCAGT GTCCAAAATG TTTGGAATCA 960
ATTGCACTGT GTGTTCATTA ACCAATGCAA ATAGTAAAGC AGTGGCTTTG AACAGGCAAA 1020
CTGTTTTATT GAAACTTTAC TAATGGCTTC TTGTTTGTAC AAACAATTAT ATTTTACAGT 1080
ATGCCAGCAA TTAAGTGGTT ACCTACTTTC TAAGAGTGAA AAACAAAACA AAACATGATA 1140
TTATGATTCT TAGATAAGGG GAATTTTAGC TAATTTGTCA TCTTTTGGGG GGAATAAGTC 1200
ATATCATGTT GCTTAAAAGC AACAAGACAT ATGTCCTCAA CATTCTGAAA GATTTGAGGT 1260