EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28437 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:33409501-33410582 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr23:33410021-33410040TAAACACTAGGGGGCAGTA+6.54
CTCFLMA1102.1chr23:33410025-33410039CACTAGGGGGCAGT+6.15
NFYAMA0060.3chr23:33409701-33409712TCTGATTGGTC-6.14
Enhancer Sequence
AGCCTTCTTA GTTCGTCAAC CTCATAGTGT TGAGCAGAAC AGTAGAAAGA AACTCAAACA 60
AGAGTGAGTA AATGACTTTT TTTAAGTGAA TTATCCCTTT AAATTTAGAC AAAAACACTT 120
GTTGTTGATG GGGGGTTTCT TCTTAAACGA AGATGAGGAA GGTAGGATGA ATGGGCTTAA 180
TTATTGAAGG CTACAATTAT TCTGATTGGT CTAGCAATGA TATTTGATTG GACTAGCAAT 240
GATTACTAAT GTGATGCCAG CCGCGATCAA TCATATCATG TCCTCCTCTC TAAAATAACT 300
TTATAAAACT TCATTTAGCG TTGTTTTGAT TGCTTGGTAA AAATCTAATG CAAAATATAC 360
ACCATTATAA TTTTTTGATT TGTATCTTCA CAGAACTTAA ACAAATGATA GTAAAGCAAA 420
ACGACAGATT TCATTTTTCT TTTTCTGGAC GAAAACAACC AAGAAAATTA AGCAACACCG 480
GCTCATTGGA AACAAATGCT AAAAACTGCA AATAAACAAA TAAACACTAG GGGGCAGTAC 540
GACGTCAACA ACTTTTGTTC CTCTTGTCTT GACACTAGTG ATATTTACAG GGACATATTG 600
TCAACTAATA AATGACCTAT TTGAGCAGTT CTTTCAAAAT AAAAATCCCA AAGCAACTTA 660
GACGCAATAT AAAAAATGCA TACGGTGTCC AGGATCAGTG ATAGAACATG TTTACCTCAG 720
CTGACATCTC CATGGTCAAC TTCTCTTTTT CTGGTAGCTA GTGTTTGAGT CCGGCAAAGG 780
AGATTCCACA AACGAAATAA AAGCAATGTA AAAAAATTCG AGGTAAAACT ACATGCTTGC 840
AGGGCACTTT TCTCCTACAT TTGCTTTTAA AAACACTATG GTAAGTGGAC ATGTTCAAGG 900
ACGGTTTTCT AAAATGTAAA ACAAAAAGTA GCGTATATAA CAGCGCTCTC TAGCGGATTT 960
GACATTGAAT AATCATAGTT AATTTGTAGA AAGTAATTTA TCAATCTTTA CATGGACTGA 1020
GGGGCGTCAC AGAGGGTACC ACAATCGCCT CACAGCAAGA CAGTTGAGCT CTGAGCCCTG 1080
T 1081