EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28343 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:31033241-31034668 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr23:31034298-31034309TATTGTTTATA+6.32
KLF5MA0599.1chr23:31034135-31034145GGGGCGGGGC-6.02
NFIL3MA0025.1chr23:31034152-31034163AGGTTACATAA-6.14
PBX2MA1113.1chr23:31034064-31034076TTGATTGACAGA+6.11
PBX2MA1113.1chr23:31033398-31033410GCTGTCAATCAA-6.32
SP1MA0079.4chr23:31034133-31034148AAGGGGCGGGGCTAT-6.13
SP4MA0685.1chr23:31034131-31034148TGAAGGGGCGGGGCTAT-6.41
ZNF24MA1124.1chr23:31034468-31034481CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
ACTGATTTGA CCTGTAATTC TTAATAATAT TTAGGCTACA ATTCAGTGTA ATATAGCATT 60
TTTAACATGT ATAGTTTAAA ATCAGAATAT TCCCCCAGAA TGTATGCCAC TGTCAACTAA 120
CGGGGATGAC AGAAACATTT CTCACATCAT CTGCAGGGCT GTCAATCAAA GCAGATGAGC 180
AAAATGAAAC CATTAAACTT ACTGGACAAT CATTTTGATA TATAATTACT TAAAATACAT 240
TAAGCACATA ATGATATCAC GAGCATGGTA ACCAAGCAGC ATATGAACAC AATCCTCATC 300
CACCCATCCT GTCCAGGCAG GTACATTGCC AAAACATAGC CTAGCCACCC GTCCATGGGG 360
ACAAGCTGAC ATTCACGTTA TACCCGGTTA GATACACAAA CGCATCAGAT ACTATGAATA 420
ACCTGCCCCG CTCGGTATCA CTAAACTAGA TAGATGTCCT GCGGGCGGAA AGCACGGAGT 480
GTCGGAGCTG TTTTGACCTG CGTTAGCCGC TAGCTCTAAG CCTTGACCAA TAATAAACCC 540
GCATATTACT CAACGACCCG ACTGATATTG TGAAAACCTT CAACGCATAC AAACAACCAC 600
GACGAACAGC GTCGATATAG CTTGACAAGC TGTCAAGTGT GCGTGTGTCG CGTTACCTTT 660
CAATAACGTA AAGCTGGATC GCTCCTTTCT CCGGTGGGAC AGAAAACAAG CGCCCAGTTT 720
GGAAGACTGA CAGTAGGGCG GACACACATT TCGCCAGGAC TGGAGAACGA ACTTGATTGG 780
ATGATTCAGG ATGATGTCCA AGCGAAGAGA GGAGTGGTCA GACTTGATTG ACAGACTAAA 840
TAGCCTATTG TAAAAGAAGA GCCCGCTGCT AACGCACGAT ATTAACCTTT TGAAGGGGCG 900
GGGCTATATT AAGGTTACAT AAAGAAGTCG GTACTAAAAA GGCAGGGATG TGGGTTATTT 960
ATAATACTAA CAATAAATAC CGCCGTCGGT TATGGCAGTG GCGTTCCTTG ATTGAATATC 1020
ACTGCTATCC AGGGATATAT TACAATAGGC AGGGCAATAT TGTTTATAGG AATTCATAAG 1080
TAAAGTACAA AAATATATTT TAACAGACAT GGTTACAAAA ATGTGCTTAA TAAGGCCATA 1140
TTTTTTAATT CGTTCCTATA ATTCCTTAAA ATCTATTATA AATGAAATAG AAAATGTAAG 1200
TGTGATTGCT GATTTCATCA TCATGTACAT TCATTCATTT ATTTTCGGCT TAGTCCCTAA 1260
TCAGGGGTTG CTTCAGCGGA ATGAACTGCC AACTTATCAT GTTTTATGCA GCGAATATCC 1320
TTCCAGCTGC AACCCATCAC TGGGAAACAC CCAAATGCTT CCATTCACAC ACATACTACG 1380
ACCAATTTAT TCAATTCATA CCACATGTAT TTGAGTGCCC TTCCAGC 1427