EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28322 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:30644840-30645872 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr23:30645034-30645046AGGTAAACAGAA+6.14
LMX1BMA0703.2chr23:30645285-30645296TTAATTAAAAC-6.14
Lhx3MA0135.1chr23:30645094-30645107GAAAAATTAATTA-6.06
Lhx3MA0135.1chr23:30645334-30645347TAATAATTAATTA-6.18
Lhx3MA0135.1chr23:30645337-30645350TAATTAATTAGCC+6.32
mix-aMA0621.1chr23:30645098-30645109AATTAATTAGT+6.62
Enhancer Sequence
TACGCCTCGC CCCAGTGTTT ATGATTGGAT TGTCACACGC CATACTAACG AGCATACAGC 60
TCAAGCATGT ATACAGCCCC CCGGTACCTC ACTGCCAACC TGACACTTAT GACAATGGTC 120
CGTCAGAGCA AAGCCAGTAG GAGAGCAGGA TGCAATGATG GTGGGTATGG GGTAAGTTTT 180
GTGACAGAAA ATGAAGGTAA ACAGAAGAGT GGAGGCCGCA GGGAGCGTGT ACTTAACTTT 240
AGAGTCCCTT CAAGGAAAAA TTAATTAGTA ACCTTAGCAT GGAGCCCCAA TATTTCCTGA 300
AAGGTCTTGA TGTAGCACAA TGTACAATGG GAGCTGGTTG TGCTAAAAAC TATTGACATG 360
TGAAGGGTAA ACTGTAGGGG AGGGAGGTGG AAGGGGGACC GTCGAGACTT CCTCAGAGCT 420
TCAATACGCT TTGACGGCTC ATCTCTTAAT TAAAACATTA CCACCAAAAA AATCATGTAC 480
GTTCATATAA AGTGTAATAA TTAATTAGCC TTCTGTGCGG TGTGGTGGGC AAAGCCAGTT 540
CATCGGCATT GCTGTCTTTT GCTGCTTGCA GTGACAAGTA TGCAGCAGTG CTGAGCTAGA 600
ATAAATGAGA TATTTCAGGC CTTGCATGAG GGAGACACAG GCAGGCGGTG CGGGAGATGG 660
AGCCGATACA TCTTTGTGCA AATAATCTCT AAAGACCACA GTAATTGAAT TTCCACAACT 720
TTCTTGTTTG CGCCACAACA AAGGAAATTA GATAAAACAA AAGAAAGAGA AGCCAATATG 780
GCACAAAAAA AAGGGAAGGC TGTAAATAAA TGTATTAGCA AAAGCTTTCA CATTCAAATG 840
CCGAACGAAG CAAACACATT ACCTAAACAC AAAGCATTGA GTCCCTGATG TGCCGACTTC 900
ACCTAAACGA ACAGGCCATT TCTCATCTCC TTTGTTTAAT TCTTTAAGCT CTGCTGATGA 960
GTCCATGAGA GCACGCTGCA GCTACTTATC CTGGCGGTGA AACAAGACCT GTGTGACTGA 1020
TCTGGGGTCA GA 1032