EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28123 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:25852423-25853629 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr23:25852902-25852916CACACGTAAACAAT+6.41
Foxd3MA0041.1chr23:25852450-25852462AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:25852454-25852466AAACAAACAAAC-6.32
Enhancer Sequence
GTAAAAATAC TGTAAGATAA GCTAAAAAAA CAAACAAACA AACAAAAAAG AAATACACAA 60
CAGTTTAGAC ATAAAAACAG CAAAAATTGT AACGTTACGT TTTTGTAGAT TGAGTAAAAG 120
TGAGGCAGTT TAACTTAAAT GTTCCCAGTT AGAAACAACA TGTTGTTTTC TTAAGTAACG 180
TTAACATTAA CAAAAACACA AATTCAGGAA TTTAAGCAAA CTTTAAGGCA AGTTAGAGGC 240
ACAAATGGGG TCATAAAATC AGAAAAGGTA TATTTCCCGG TGTCCCTGGC GTCATCCTAT 300
CAGAGCAGTT CGCGGTTAAA TGGCCGAACC AAAACACCAT CTATGACCCA ACCAAAACAC 360
AGTTACATGT GACTAAAAAT AAACATTTAA ACACCTAAAC TTCTATTGTA TTGCCCGATA 420
ACGCATAAAC ATACCAATTA TTACACATAT AAGTTAAGCA CATATCTTAC TATGCTTTGC 480
ACACGTAAAC AATCTCTCAC CAGTTTATGG ATCTTTTTCT CCGTGACGTC CCGTCCTGAT 540
CCACTCTCGC GGCATCAGCA TTGACTGCAC CGGCAGGAGC TCCATTTCTG AGACTAGCGA 600
AGCCGGTTCC AAACCATTCG TAGATCTTAT TAAACATGTT GAAAGCCTCG ATTATGAGCA 660
GGATAAATCC TCAGGGCTGT CAGCGCAGTC CCAAACGCGG GCTCCCCCTG CCCTTCATCC 720
GCACGCCACT GCTAACCAGC TTTGTTGAGA TAAAAGTAGC TGAATCCTCT AGGTGAACAC 780
GACTAAACCA GTCCAGATAA ACCCACAGCG CTGATCTTTA GCTCAACCAG CTAACCAACA 840
GCTAACACGC GAGAAAACAG CTCAGCTTTA AATATAACTG TGCTTAACGA GCTCCGGCGA 900
GCTGCCCGCG AGTGTTAGTA TCAGTTGTAG CTATCTTTTT CTAACGGACT CGACTTTCTC 960
AGAAACAGCA GGTGATTCCG TGAATGAGAT GTTGAGTACA CAAAGTTTCA TTAACGCCTC 1020
CCGCTTCTTC CTTATTTAAA AGAAGAACAT GGCCGAAGCC CACATGTAAA GACCGAGCTT 1080
TCCCATTGGA TGAGGGGAGC GGAATTGCGT CATCACTTCG CAGTGTTTTG AGACGAGAAT 1140
GGTGGGATCA AGTGCACTGT GTGTCCGTGG TTTACATACG CTCTCACTTC AGATTCTCTT 1200
TTGTGG 1206