EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28080 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:25233442-25234500 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr23:25234411-25234422AAGAGGATTAA+6.14
EWSR1-FLI1MA0149.1chr23:25233535-25233553CACTCCATCCTTCCTTCC-7.16
EWSR1-FLI1MA0149.1chr23:25233543-25233561CCTTCCTTCCTTCCTTTT-7.95
EWSR1-FLI1MA0149.1chr23:25233539-25233557CCATCCTTCCTTCCTTCC-9.55
GATA5MA0766.2chr23:25233846-25233856TCCTTATCTG-6.02
Gata1MA0035.3chr23:25233846-25233857TCCTTATCTGT+6.14
PBX3MA1114.1chr23:25233673-25233690CCGGCTGTCACTCACAC-7.1
ZNF263MA0528.1chr23:25233916-25233937CTTTCCTGTCCCCCCTCCTCC-7.95
Enhancer Sequence
TAGAAGACAG AAAACTGAAA CCTCTTTGTC AACAAAATGC ACTCACTATT TGTTTTGCCA 60
AAGCTATTTA CAATTGAAAC ATTGTGTGAC ACTCACTCCA TCCTTCCTTC CTTCCTTTTA 120
TTTATTGCTC CGGCAGATCT GATCATACTC ATGCTATCCT CCACACCTCT TCCACTCCCA 180
CATGGCCAAA CTTCAGTTGG TTTTGTTGTG GTGGAATTTT GTCCATTGTC ACCGGCTGTC 240
ACTCACACCA GCACATATTT TATCTCGGGA AAATCTCTCC AACTCTTTTT GTGTGCGTGT 300
GTGTGTGTGC GTGTGTATGT GCACGACCCC CTCCTCCATT ATCTCCCTCT CTTGTTCTCA 360
TTCACACACA TTTTTCCCAC CCATTTCAAC ACAAACCCCC TCCTTCCTTA TCTGTCTCCC 420
TCCCTGACTG GCTGTCTAAA ACCTTGATGT CCTCTCTCTC TCTTACCCAC AATCCTTTCC 480
TGTCCCCCCT CCTCCATTTT ATCCACACTT TTTTTCATCA GCTTCATCAT AGCTCAACCC 540
CCCAAAATCT TTCTGTCTGC CCCCTCTCGA AACACACACA CACACACACA CACACACATA 600
CACTACGTTC CCTGGCTCCC TCTTTGTCTG CCTCAGTAAA TCAGCAGAGC CTGCTCAGTT 660
CCAGGGGATT AATGTGTGTA TGCTGGTGAA GAGAGCAATG AAAAAACTAG GAGAGGCAGA 720
GAGGGCTCGA TTTTTGTGTA GCGCCTGTTG TGTTTGGAGT TTTAGAGCTC TGTGGGAGCG 780
GAGTTTGTCC GAGGAAGAGA AAGTCAGAGT GCTTTAACAA AACGGTGCGC TGATTAGCTC 840
TACCGTTGTT GAAGAAGAGC TTGGATGTGA GGTGATATCC GACATATGTG AAGCTCCTTG 900
TCCAGTGTGA GCTTCGATTT AAAGGCCCGT CAGACTTTTT ATACTCCCAG GAAGCATTTG 960
CACATTTCAA AGAGGATTAA GTGACAGGCA TGGATATTTA AATTAGCAAC ACATCTGGGT 1020
GAGGTTGAAC ACCGTATGTC ATGATTAGTC CCACATGC 1058