EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-28042 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:24629782-24630756 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr23:24629817-24629836AACTGCCCCCTGGTGGCGA-7.29
CTCFLMA1102.1chr23:24629818-24629832ACTGCCCCCTGGTG-7.34
Lhx3MA0135.1chr23:24630563-24630576AAATTAATTAGCT+6.15
SIX2MA1119.1chr23:24630412-24630428TTATCAAGTTTCAGCA-6.04
YY2MA0748.1chr23:24629927-24629938GTCCGCCATTT+6.14
ZNF24MA1124.1chr23:24630257-24630270GAATGAATGAATC-6.74
Enhancer Sequence
TATATTTATT TATTTATTTA AAAACATAAT CATAAAACTG CCCCCTGGTG GCGAATATGT 60
GTTTCGCTTC ATCCTTGCAT TACGGTGGAG TGGGCGGAGC CTCGTGAATG ACGGTTATTT 120
TTTTCAAACG AGGAAGTGAA GTCAAGTCCG CCATTTCATC TTCTTCTTTA TATCGGGTAA 180
GTTATTATTT TAAAATCATA TTTGTGAGAT ATTTGTCGTC AGGCAATGTT TTTATTTGTT 240
AGAAAAGCCC CTGTTTTGAA TAGTGATAAA ACTGTAACTT ATATGTGGAT AATATGGCTA 300
AAAACGGCTA AGAATGATGG CAGCCGTCAG TTCAGTAACG TTAATCTGTT AAGTTGATTG 360
TGCTCGGGGT TTTAACAAAT TCATTTAAGT TACAATTGTC CTTTTACGCT CGTCATTCCC 420
AATTAAATGA TCAATAAGAC GTGTTATATG AAGAACAGCG TCGAAACTGG AGCTTGAATG 480
AATGAATCAT ATGCTGTCCG TTTTATACAG TTGTAATCGG TGCCGAGTTC TGCTTTTGTA 540
CTGGTTTTAG CTCAAACACT GAACGAACAG TCTCTTTTTG ATAAGTTAAC TTTAATCTTA 600
ATGATTTTAA TTTGCTTGTT AATGTGTGTT TTATCAAGTT TCAGCAAAAG TTTGTAGAGT 660
AACGTTATGT GGTTCATGCT GGCCACTGTT GAGACTGGTC TGCATAAAAT TTTTTTTAAA 720
GCCAAAACGT TTGAAAAAAA ATCCACAGTT GAAACATGAT GTGTTAAATG ACTTATAAAG 780
GAAATTAATT AGCTAAAAAA GAAGGCTAAG TGTGTTATGA AATATTAAAC CTTGTTAAAA 840
AATAAAATCA ATTGTGTTAA ATAAGCTTAA AATCCATATC TTATGTTTTA TATTACTTTA 900
AAACAGCCTG GAAACTGAAC TGCACCATTA ATCTTGTACA TATGTATCAA GTCCAAACAA 960
ATGGCTTTGT GGCA 974