EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-27793 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:20411958-20413006 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr23:20412581-20412591ATCACGTGAC+6.02
CDX2MA0465.1chr23:20412603-20412614TTTTATTGCTT-6.32
HOXD9MA0913.2chr23:20412602-20412612GTTTTATTGC-6.02
MITFMA0620.2chr23:20412577-20412595CATGATCACGTGACTTCG+6.3
MITFMA0620.2chr23:20412577-20412595CATGATCACGTGACTTCG-6.3
SREBF2(var.2)MA0828.1chr23:20412581-20412591ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr23:20412581-20412591ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr23:20412581-20412591ATCACGTGAC+6.02
USF2MA0526.2chr23:20412579-20412595TGATCACGTGACTTCG-6.12
Enhancer Sequence
TTTAATCTTG GAAACAGCAG CAAATGTGCA GCACTGCACT TGAAATGAAA AGTCCATTTA 60
AAATAGGCTT TATGTTGCTG CCCAATTTCG TAAGTCAGTG CACTATTCGG TTTAACTTCA 120
ACCTTTAAGC ATTTGAAAAG ACTTTTATTA AGACGTTATG CTCAAAAGGT AGTTGTGAAT 180
TAATCAAAGT ACAAAGTTAT AGCTCTTACC TGTGTTCGGC ACTCATTAGC ACGAGCGCTC 240
CTCTCGCGTG CTGCGCGTCC ACCTGTTCAC ACATGCACAA CTCACTGAAG GAGGAGTGCT 300
CTCGCTTTTC CCTCCTTCAG ACAGTATTAT AAACAGGTAA GAGAGTGTGG CGACATGATG 360
GCTTGTAGTA ATCTAATGTA GTAATGTTCG AAGCTGACAA GGTTTACGCA AACTTGGCGG 420
TAGTTCATCT CCTCTCTGCG TACCACGTAC GTTGCTACTG TAGTTAATGT GTATGCTTTG 480
TCAGATTTCA AGGTTTAAGC CGAGGCTTAA GTAACAAAAT CAACTAGAAA CTGTACTATT 540
ATTTTAAAAG AAATAAAACT ACACCAGTAT CGATACTGAT CATCCATGTA GGCTATCATC 600
GAATATACGC CAAATCGTGC ATGATCACGT GACTTCGGAT ATTTGTTTTA TTGCTTAAAC 660
TCATAGTTTG AAAAGTTATG TATTTGCTCT GTGAACATTT CATAAGGAAG AAAAATAGCA 720
CAGAAAATTA TGTGGAATCA AATCTTTGCT CATAGTTTTC ATCCACGAGT GACAAAATAA 780
CTAAAGTAAA AAGTATAACT CGCTAAGTAA CTAGGTAGTT TTTTCTATAG GTGCTTACTT 840
ACTAACTCTC CAGCACTATA ACACGACACG TATTGGTTGT TTTATAATTA ACCCTAAATT 900
GTTAGTTATT AGTGGTTAGT GAGAACAAGG GCAATAGGGT TAATAACGCA TGAACAGCCG 960
AGGTCATCTA GAGTACAAAG TTTGTGTGGG ATGATACAAC TTAATGGTTT CAGGCATTAT 1020
GGTTAGGAAT GACAGCTATT TATTGTAT 1048