EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-27642 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:16558287-16559491 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK1MA0852.2chr23:16558802-16558816AGCTTGTTTACTTT-6.17
FOXP1MA0481.2chr23:16559357-16559369GTGTAAACAGAA+6.22
LMX1BMA0703.2chr23:16558391-16558402AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr23:16558394-16558405TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr23:16558405-16558418TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr23:16558402-16558415AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:16558401-16558414AAATTAATTAATT+6.92
NFYAMA0060.3chr23:16558844-16558855TCTGATTGGCT-6.32
NFYBMA0502.1chr23:16558845-16558860CTGATTGGCTAGTGT-6.47
PHOX2AMA0713.1chr23:16558390-16558401TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr23:16558406-16558420AATTAATTATTTAT-6.63
POU4F2MA0683.1chr23:16558404-16558420TTAATTAATTATTTAT-6.65
POU4F3MA0791.1chr23:16558404-16558420TTAATTAATTATTTAT-6.78
POU6F1MA0628.1chr23:16558403-16558413ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:16558403-16558413ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr23:16558390-16558401TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr23:16558390-16558401TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr23:16558390-16558401TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
GAAATCAGAA ACAGAAAAAT TTCTTCGCAA TGCAGTCCAC AAGCCTACTA CTACTAAGTA 60
CATTGTGAGA TATTATAACT GAGTCAACAA GTCAAGAATT TGTTAATTTA ATTAAAATTA 120
ATTAATTATT TATTCTGTCT TCATGCCATA TCACTAACTC TATTAGTATT TGGATTTGTC 180
ATGTTCCACT TCTATACTAA AAGTATTAGT TTAAAATTTG GGAGCAATAA ATGCAATGCC 240
AACATAATTG GTCTTTGTGT TTAACGTTAG AGCAGAAACA AAGTTGAACA ACATCAACCT 300
GCTAGCTAAA CCCTGGTCTT TCACTGGACT ATCGGCTGTG GTCGTACTAG CTGGTCCTCT 360
CGTGTCATCT GCAAATCTCC TGCAATTTAG TTATGAAACA TTTGAATGCT TCTACTACAT 420
CTACTTTCAC CCCCACCTTT ACGTTTTAAA CTCTGATAAG TCGAGTCGGA GACAGTCCAC 480
GAGGACTGCG ACCCATGCAG CTGCCACGAA AGAGAAGCTT GTTTACTTTT CCTACGCGCA 540
TTCCGCGAAG ACCTGCCTCT GATTGGCTAG TGTTCGTTGC AATCGTTGGT TAGGTCAAAG 600
AAGCTCTTTG GTTAGGTTTG CGCAAGTGGA GCGACGTCAC GATCGGTCGG AGCCAGTCAG 660
CTTCAGAGCA GGGGCGGGTC TACGGGTGTA AAAAAAATAC AAACTTTTAA AGAAACGATA 720
AATTCAGGTA CCCAACGTAA CTTATGCCTG CCATTATGTT TATGTAGAAA CATAAATTCT 780
TGCCGCCAGT GCACATTAAC CACATTTTAC CAACATGATT TCACAGGTCT ATTTTGTTCT 840
AATGTTAACA CATTGACAAG ATTAGAAGAA ATGCTTACAG CCAGTCAGGA ATAACGTTAT 900
GTAATGTTAG GCTTGGCCAG TCTAACGTAA CGTACTAACC TTACACAACT CACGTAGTTA 960
AGCTAATCGC TGACACCTTA GTTGTAATTT AATTTAATGT AACGTTAATT GATATAAAAA 1020
CATACCAATT TAGCATTAGC TAAACACATT TTTCTATAAA ATGTTTAAAA GTGTAAACAG 1080
AACCCTGTTT AAGTAACATA TATAACACAC CAATGATTAT ATATTGATTA CTTACCGAAA 1140
ATGCAGAGCT GGATGCAGCA TTCAAATGAG TGCATCACGT TCAATCTCCC CGCCTTGGCC 1200
CCTT 1204