EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-27175 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr23:2956651-2957657 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr23:2957365-2957382AGTAATTAATTAATACA-6.47
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
Lhx3MA0135.1chr23:2957367-2957380TAATTAATTAATA+6.25
MSCMA0665.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
POU1F1MA0784.1chr23:2956707-2956721AATATGCAAATAAA+6.34
POU2F1MA0785.1chr23:2956707-2956719AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr23:2956708-2956721ATATGCAAATAAA-6.98
POU3F3MA0788.1chr23:2956707-2956720AATATGCAAATAA+6.04
POU5F1MA1115.1chr23:2956708-2956719ATATGCAAATA+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:2957369-2957379ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:2957369-2957379ATTAATTAAT-6.02
Tcf21MA0832.1chr23:2957432-2957446GAAACAGCTGTTTA+6.03
ZNF384MA1125.1chr23:2957448-2957460AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:2957449-2957461AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:2957446-2957458ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr23:2957447-2957459TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr23:2957445-2957457AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
AGCATATAGG AGTTATTAAA AAATAACCTG ATCACTGACT AGAAGGACAG GTTGTAAATA 60
TGCAAATAAA ATAGAGGAAT AATTAAACAG TCAAACTGAT CACAAACCCA ACTTCAGCAT 120
GACACTGTGT ACAGCAGATG TGCTGAGCTG AAGATCCCAG CTCTAGTAAA TCACACACGT 180
GTGCCAACTT CAGCTTATGA ATACTAATAT TATGAAATAT GATCACATAT TATAAACCAT 240
AACCACAAAC TACATCCCCG CCCCTTCTTC CTGTCGCCAT TACAACACAC ACACACACAC 300
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACTTTC CACGCATCAG TGCAGTATAA GCTGCTGTAA TGATAGATAG TGACGTCGTT 420
GAGTAACAAT GAAAGTCGAG CACAAACTCA CCCGCGTGCA CGAGCCAGAT GCCGTCAGAA 480
ACGCGCCATA CACACATCAA CGCTGGAAGA TAGAAACATG AGTGTAACAC AAAGGCCCTT 540
CACTCTTGTT TATGTCCAGT CGAGTGTGTG TCTGTGTGTG AGAGAGTGTG TGTGTGTGTG 600
TGTTAAACGG GGAAAGAAAC TCACGCCGTA CGTCACCAGC AGCTGCGTCA TGTGACTGTA 660
TGCGTCACTG GCATCCGAAG CTGTGATGAT CCGCTCATGG GGAAACTGAT AATGAGTAAT 720
TAATTAATAC ACAAACACGC ACTGTTATGA CTGAATCTCA TCTCTGTGTC CAGAGCAAAC 780
GGAAACAGCT GTTTAATAAA AAAAAAAAAA GTTCATGATA GTTGAAGTTG TAGTGATGCC 840
ACCGGGTAAG CAGGTTTGTG TAATTTGTTT GTGATTTGCT GCAAGGTCAA ATGAGGTATC 900
CCTGCTGAAA AATCCAGCTT AAACCAGTCT TGGATGGTTG GCGGGTTTTA ACTGGTCGAC 960
CAGTATGGTT TTAGAGGGGT TTTGGACACT TCCAGGCTGG TTTCCA 1006