EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-25958 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr22:11138250-11139392 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr22:11138369-11138388GAGCGCCCCCTGCTGGCCT-7.77
CTCFLMA1102.1chr22:11138370-11138384AGCGCCCCCTGCTG-6.84
Lhx3MA0135.1chr22:11138550-11138563TATTAATTAATTA-6.25
POU6F1MA0628.1chr22:11138551-11138561ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr22:11138551-11138561ATTAATTAAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr22:11139044-11139065CTCTCTTCCCTTCCGTCCTTC-6.38
Enhancer Sequence
CATGGGATTT TTAATGACCA CAGAAAGGTT AAATGTATCA TCCGAAAGAC GGCGCTCACT 60
AACAGTATAG TGTCCCCTTC ACTATACTGG GGCATTAGGA CTCACACAAA GCACAGGTTG 120
AGCGCCCCCT GCTGGCCTCT CTTACACCCC TTCCCCCAGC AACATAGTTT TCCCATGTGG 180
TCTCCCATTC AGGTACTGAC CAGGCTCAGC CCTGCTTAGC TTCAGTGAGT AGCCGGACTG 240
TAATCAACAC CTATTTTATA GGAAATCTGC TTTGCTTTCA TGTGTTTTAC TTTCAAATTG 300
TATTAATTAA TTATGTTGTC AGAAAAGTTC TGACAATCAT GATTTTGATT ACTGGAGATT 360
GTTTTGAAAT TGCGAAATAC CATCCAATGG TTTGGCCTGG TTGTTGTATA TTGGTGTTTT 420
TCTAGTTGCT CGTGCGTGTT TTCGTAGTCT GCATGTGGTC TTCTGTCTTT GGCGTCCTCT 480
GTTCTTGCTT GCATGCGTGT GAGATAGATT TCCTCTGTGC GGTGGGGCTC TCGCTGCCTG 540
TGTGTATGTG TGTGTGTGAG CGCGACCGAA CGGGGAATAT GATGAATAAT GGAACAGATG 600
TGGAGCGTGC TCGGTTTCTC TCCCTCTCTC TCGGCCTTGC GCTCACCCTT TCATCGTCTC 660
TTCCCTCGCT GCTGCGTTTC TCTCTCTATT CTCCCACTTT AACGTCCGTC CGTCATTTCT 720
CCTTTTCTGT TCGCCGTTGC TTCCCTTTTC ATTTGATTTC CCTCTCTTAT CTTGCTCTCC 780
CTTTCATGTT TTCCCTCTCT TCCCTTCCGT CCTTCTCTGC CGCTTGATGT TATCACTTAA 840
ACGTGCCTCT TTCGCTTCAG CTCTGGTCAC GTGAGGCAAA ATAGAAAGCA GACGAAGGGA 900
AGGATGTATC ACTTTTTTTG TTGTGCATGC GTGTGTGTGT GTTAGAACTC TTTCGTCTTT 960
TGTCCATCCA TCCTAACGCG GTCAGCCTTC TGCCGCTGTC AGTCTGATTT ACCTAACAAG 1020
ACCTTCAGGA AACTGTGGTT GGTTTGTCTC TGTGTGGTTC ATCTGTGATG AAATCGCTAG 1080
CAACAACACA AAACAGAAAT CCCAGATTGT GCGCTTGCAT TTGTTTGTGT GTTTTTACAT 1140
GT 1142