EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-25671 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr22:4122157-4123521 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr22:4122677-4122698TCTTGCTTTCGCTTTCAAAAT+6.33
IRF1MA0050.2chr22:4122830-4122851AAATGCAAAGTGAAAGCAAAT-6.75
IRF2MA0051.1chr22:4122834-4122852GCAAAGTGAAAGCAAATT+6.52
IRF2MA0051.1chr22:4122676-4122694ATCTTGCTTTCGCTTTCA-6.5
LMX1BMA0703.2chr22:4123302-4123313TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr22:4123299-4123312AAATTAATTAAAT+6.07
Enhancer Sequence
AGAGAGAAAG ACAGAAAAAA AAGAATAAAG AACATGATAT AAACTTGAGG GTAAGACATT 60
TAAGAATCAA GAACAGTACA TAAATTAAAG TCATTACAAA ATGAAATAGT TCTGTTTGCA 120
TTCTTATTTT TAGATACTCA CCTAAAATAA TAACTCTGAA CTGCTTGGAT AAGACGTCAT 180
TTCCGCCGAC AGTATTTAAT TCGTAGAGTC CAGCGTGTTG GGATGTTGCG TTTGCGATGG 240
TCAGAGATCC AGTTTGAGCA TCCAAACTCA GTTTGCCTCT GAATTTCCCG TTCAGTACTT 300
CATTATATAC TGATATCTTG TTGATGGCGT TGTTGATTTG AGCTATTCGG GTGCTGTCAG 360
GTCCAAACGT CCATAGAACA CGCTCATATT TCTGAACATT TGTAAGAGCA GATTGTAGCG 420
TGACAGAATC TCCGTCATGC ACCAATTTGA TATTACCAAA CGCACCTGGA TAACAAAGAG 480
AAGTTTATAA GATGCGAAAT AAATAAACAT TAAAGTGCTA TCTTGCTTTC GCTTTCAAAA 540
TATATGAAAA CCTCTTATAT TGTAACGTTA GCCGTTTAGC TAGCTCAGAA GGCGAATCAT 600
TTGTGGGTAA ACTACCAAGC TCACGATGTG TATGTAATAT AATAATATAA ATAATTTGAA 660
AACATACAAT TCCAAATGCA AAGTGAAAGC AAATTACCTT TCAGCAAGAA GCACATACAT 720
AAACAAAATA GCGTCATTTT GATGTAGTTA GATGTAAACT TAGCAAACTT TCTTGTCTTC 780
ATTGGCGGTC CATTCAAACC CGCGACACAC CTTAACTAAT AACACTATAT TTAACCAAAA 840
CATCAATAGA CTTTATAGCG GTAACCATTT GTGATGTATA TTCTCCTTTA TATTCTCATG 900
ATAAGCAAGT CCAGTATTTC GAGTCCAATA TATTAAGTTT CGAGTAAAAG TAGATAAGAT 960
AGCCGAGTGT CAACACTCTT CCTGTTTGAT CAGGTGATCT CCGCCTATAT CAATGGGAAA 1020
GTTTTGGGAA TATGACGCTG TGAAATATGG ATTAATCAAA TGGTAATGAA ATTAATGATT 1080
TTAGCCTAGC TGTTAATGTA TTTTAGGCTA CTCTCTAGTT ATGTGAGGAT ATTTTATAAA 1140
TTAAATTAAT TAAATTGCGT ATAGGCGATT GTCACATGTT TGAAGGTAAA AAAAAGTTTT 1200
GTAATAAACA ACGAAAGTGA ATGACAAGCA AGTATCTGAA AAAAAGCCTT TTAAAAATGG 1260
TAGTGCGTCT TTTTTCTTAC TTTCGTTTCT CTTTAAAAAA TCCCCCTGAT GGCCACTTGG 1320
GGGAAGTACT GATACGGATA GGAATGCACA CAAAAGTTAA AGGG 1364