EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-25465 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr22:527486-528598 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GRHL1MA0647.1chr22:528028-528040AAAACCGGTTCT+6.07
Hmx1MA0896.1chr22:527834-527851AAGTATTAATTGCTTAT-6.32
Hmx2MA0897.1chr22:527834-527851AAGTATTAATTGCTTAT-6.87
Hmx3MA0898.1chr22:527834-527851AAGTATTAATTGCTTAT-6.61
NFYAMA0060.3chr22:528061-528072GGCCAATCAGA+6.02
ZNF143MA0088.2chr22:527705-527721CAGTGCATGCTGGGTA-6.69
Enhancer Sequence
TGGAAAAGTA TTCAATCCAA TTTAAAGATG ACCAGCTGAC CAATCATGTA ATATTCAGAC 60
TGTTAGTATA CTTTTGAGAC GCTAAACTGC GCAATAATGA ATACACAAAT GCACAATATG 120
TGCTAATGCA GTGAATATTC CCTCTCCAAC ACACATTTCG CTCATTATTA TTTATTATTG 180
ACACTCAATC TAGAGCTCGA TTTGATTTGA CCGCAGTTGC AGTGCATGCT GGGTAACACC 240
CGGTGCTTTA GTATGCAGGC TACTTTACTA TTATAAACGG GAAAGTCCAT ACTTGAGCAG 300
TTTACACTCT TTTGATCGCT TTTTATTGTA GTTTTTCCAT CCGTGGGGAA GTATTAATTG 360
CTTATACACT CGTTTATATA AGTACACTTA TATTTTTTAG TAAAACAATC AGAAAAGGCT 420
GTGTTATAAT GAAAAGCACA AGGTTAATCT GTCCATCTGA CCCCGCCTCT GGAGCTTTAA 480
AACCTGACGG ACATCCGCAC AGCCGATGAA AAGCCGGCTT ATCTCCGTCA CTGCGACCAA 540
TCAAAACCGG TTCTGCTGGT GATTGACGGC TCCTCGGCCA ATCAGAGCGC AGTGATGCCG 600
CGGTGGGCGA GTTCGGTTGC GTTGAAAATG GTGACAGCTC GCGCGTGCGG ATGATGGCGG 660
TAAATAACAG CCGAAAGCGA GCGTAAAAAA AGCACGCAAA TATAAATCGC GATTAAACTA 720
GGCAAGCGCG TTATACCGGC TGTTACGCGG AGGACTCGCA CGGCGGAGCC GTTAAAAAGC 780
CGGTCGGTGG GTTCCGGTGT GAGTTTATTA TGTGTCTGCG GCTCTTGCTG GTTTTTGTTC 840
TGCGGGTTTA AAGTAACAGA TCTCTCGCGC CGGTATAAAC ACACACACAG ACACATTAAC 900
ACACCGATCG AGCGCCGGTA CCGGAACCTC CCGGATCCGC AGCTGCCGCG GGTTCCGCGT 960
GTCTCCCGGC GGAGCGTCTT TTGTTCTGTG AGTAGCGCTA GCGGTTAGCA CACACACACA 1020
CACACACACA CACTCAAACA ACAGACAGAC ACACACTCGT AACTCAGGAA CACACACTCA 1080
TATAAGTGTA CACACACTGC ATTGTGACAC AA 1112