EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-24086 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr21:5834369-5835724 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FERD3LMA1485.1chr21:5834834-5834848GCGGCAGCTGTCAC+6.73
IRF1MA0050.2chr21:5834978-5834999TTTCATTTTCATTTTCATTCT+6.6
IRF1MA0050.2chr21:5834972-5834993TTTTTTTTTCATTTTCATTTT+6.82
Klf12MA0742.1chr21:5834886-5834901TCTGTGGGCGTGGCC-6.17
POU2F1MA0785.1chr21:5835305-5835317AATTTACATATT-6.02
SP1MA0079.4chr21:5834888-5834903TGTGGGCGTGGCCAG-7.01
SP3MA0746.2chr21:5834888-5834901TGTGGGCGTGGCC-6.64
SP4MA0685.1chr21:5834886-5834903TCTGTGGGCGTGGCCAG-6.57
SP8MA0747.1chr21:5834888-5834900TGTGGGCGTGGC-6.22
Enhancer Sequence
CCTAGCTCAG TAAAGTTGGC CTTAGGTTTG ATATTCGCGC ACGCAGTTTT AGGGATCATC 60
TGCGATTTAC ATCAACAGAA CCAAAACGCA CAGTAACGCA AAGCAGAAAA AAATTGAGGA 120
GATTCCAATA AATGGTTAGA GGCCAGACTG ATTTAATACA GGTAGCAAAG CTACTATACC 180
TCTAACTATA TGGTACATAC AATGCAGAAA TAGGCAATAG CTCTTGTCAT AAGCATACAG 240
TACACATCAG CTAAAGCCCC TTTAGGTTCT GTCGATGTAA TTTGCAAATG ATCCCTAAAA 300
CTGCGTGCGC GAATATCAAA CCTTAAGCCA AGTTTACTGA GCTAGGAGGT GATTGGTTTT 360
CTAAAGTATT TCCCAGTTCA CGCTCGAGGG CTCGTGCAGC TTCACGAAGC CGCTGAGGAA 420
CAGACTTCGC CATGTTTATG CTGCCAAATG TCCCTAATAG TCCTCGCGGC AGCTGTCACG 480
ACATAACCTA AAACCCGCCT TGCAGCAACG GTGGCCGTCT GTGGGCGTGG CCAGGCCAGA 540
ATGCATTTTC AATTTCAAAT TGGCTTTCAT TCGTCGCGAT GTGTTAAATG AAAATGCATT 600
ATGTTTTTTT TTCATTTTCA TTTTCATTCT GCAGCAAACA TTGCACATAT GTCTTGGAAA 660
ATGCTAACTG AAATACAGAA ATACACTTTT ACATACTGCA TTATCGTTTT GCATATTACA 720
TTTCAAAATT AATTTTGCTA CACACATCCC ATGCTGTTAT GCTGAAAATG TAATCCTGCG 780
TTTCCTAGAC GCGAGCGTAA ATGCATTTAG GACAAATAAC ATTTAAATTA TCATTTTGCT 840
ACAGTTTCTG CTTGTACTTT ATTCACATCA AATTAAGTTT GTGTGTAGCA TTTTCAATTT 900
AATTTTGCTA CTTATAAAGC TTTAAAATGT GGATACAATT TACATATTAA AACAGTGTTT 960
GAAATGAGAA ATGCAAACAA TGTAATTTAA TTTACATTTT CATTCTGCAC CAAACATTGC 1020
TCATATGTCT TGGAAAATGC AAATTCAAAT ACAGAAATAC ATTGCCATTT AACATATTGC 1080
ATTGCCATTT TGCATATTAC ATTTTGAATT GAATTCTGCT ACTCGTATGC TTCCATAGGA 1140
GGACTGGTGG GAACCATCAA GTCATCTATG CTAAGATGCT AATAGTGAGT TTATTAATAT 1200
GTTGAAACGG ATTCAGAAGA AGATGGGGAC TTTGGTAATA TGTTGTATGT GTTAAGTTAT 1260
CTCTTCAACG TCAGACATGT AACGATCATT TATTTCGTTA GCGTTACCTG TTGGCATGAC 1320
TACATTATCA GACGGCTAAT AATACGTTAC TAATG 1355