EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-23992 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr21:3352237-3353334 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr21:3352862-3352873GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr21:3352862-3352872GCCCCGCCCC+6.02
NFYAMA0060.3chr21:3353243-3353254TCTGATTGGTT-6.62
NFYBMA0502.1chr21:3353244-3353259CTGATTGGTTGAGTC-6.86
POU1F1MA0784.1chr21:3353160-3353174CTGATTTGCATATG-6.07
POU2F2MA0507.1chr21:3353160-3353173CTGATTTGCATAT+6.5
Pou2f3MA0627.1chr21:3353159-3353175GCTGATTTGCATATGA-6.24
SP2MA0516.2chr21:3352858-3352875AACAGCCCCGCCCCCTT+6.72
SP4MA0685.1chr21:3352859-3352876ACAGCCCCGCCCCCTTT+6.41
ZNF384MA1125.1chr21:3352336-3352348TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
TTTTTTTCTC CTTTATATTT ATATTCAGTT GTTTGTTTGT AATATTACAA GTGATCCAGG 60
ATTCTGGCTA TATTCATGAT CAAATTATGC AACAGATACT TTTTTTTTTA AGTGATGTCA 120
TGATTTTGGT GGAATTTGGT AGAATATGGT GGCAAAAGCA GGAGGAGATT CAGATGTTCA 180
GACAGAGAGT GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GACAAAAAGA 240
GAGAGACAGA GAGAGAGAGA GACAGATGGA CAGAGGAGGA AAAGATGTGA AAGGAGGAAG 300
AAGGAGACAC AAAGCAGGGG TGTGGGGCTT TAATCAGGAC AGCAGACAGA AGTCTGACCC 360
AGCAGACACA CACACACACA CACACACACA CACACAGACA GACAGACACA CACACACCGC 420
AGACACACAC ATCAGACATC TGCAAGACTC TGGCCTCAGG CTGTTTGTGG AGCAAACACA 480
CACACAAAGT CAGACAGACA CACACACACA CACACTCCAT TTACATGTCT ATTGTCCCAG 540
ACACTCAGCC CCTCTCTAGG GCACCGAGCA GGTCATTTAG CGGCCTCTAG GGTGTAACAC 600
TCTGACCTGT GTGACCTCTT AAACAGCCCC GCCCCCTTTA CACACAGGCC CCGCCCTCCC 660
TTTATGTCTG CGCCAGGTCT TCATGTCTAG ACAGAAGACC TGTGTGCTGT CTGGACCCGC 720
GCACACACGT ATGCACACGC AAGCAGGCAC GCACATCTTT ATGGAGACTA ATGGAGCTCA 780
TGAAGATCAT GTCAAGGTTA CTCTTTACAA CAGGTATCAT CATCAGATGA TCAAAACACC 840
AGCAAGCGTG CATCAGCAGG ACACTTAATA TTTCACCAAT GTGCACGAAG ACTCTTAGTG 900
TGAAATGTCA TCTTTTTAAG CTGCTGATTT GCATATGAGG GAAAATAATA TGCACTCTTT 960
CAACCATTTG CAGCCAAATA ATGTTTTTGT AGTTTCAGTC CTTGATTCTG ATTGGTTGAG 1020
TCACGTTCTG TTGTAAAATA CTCCACAATT AAACACCCTG TGACTGCTGC TTGACAATAA 1080
AATGTAGGGT CCCACTT 1097