EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-23597 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:48738286-48738662 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr20:48738634-48738649GAGGTCAAAGGTCAC+6.04
HNF4GMA0484.1chr20:48738633-48738648AGAGGTCAAAGGTCA+7.22
NR2C2MA0504.1chr20:48738633-48738648AGAGGTCAAAGGTCA+8.25
NR2F1MA0017.2chr20:48738632-48738645CAGAGGTCAAAGG+6.74
Nr2f6MA0677.1chr20:48738634-48738648GAGGTCAAAGGTCA+8.42
RARA(var.2)MA0730.1chr20:48738642-48738659AGGTCACCCTGAGGTCA+7.84
RARA(var.2)MA0730.1chr20:48738624-48738641AGGTCATGCAGAGGTCA+9.08
RXRBMA0855.1chr20:48738634-48738648GAGGTCAAAGGTCA+7.95
RXRGMA0856.1chr20:48738634-48738648GAGGTCAAAGGTCA+8.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr20:48738642-48738659AGGTCACCCTGAGGTCA+8.27
Rarb(var.2)MA0858.1chr20:48738624-48738641AGGTCATGCAGAGGTCA+8.42
RxraMA0512.2chr20:48738634-48738648GAGGTCAAAGGTCA+8.12
Enhancer Sequence
AGACACAAAC ACACACAAAC AAACACACAG ACATTAAGTC ACACTCATGT GCGCACACAC 60
ACATACCTGC ACACATACAT ACACACACAG ATTCACTTAC AAACACACGC ACACTCATAG 120
ACACACACAC AGGCATTCAA ATTCACGCAC ACATACACAC TAATCACTGC TGGTACTCTG 180
ACATGTGTGT ACGTGTATGT GTGCAGGGTG TGTGTGAGCG TGTGTCGTCC CCTCAGGTTC 240
TCCAGCTCTT CTACTCGGTT CTGTCTCGTC AGTTCTCTCT GTGTCCCGAT CACATGACCT 300
CCTTCTCAAG GAAGCTCGGT AGGTTTGAGC ACAGTCAGAG GTCATGCAGA GGTCAAAGGT 360
CACCCTGAGG TCAAAG 376