EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-23139 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:33804551-33805771 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr20:33804901-33804914GTTTAATTAATTT-6.28
NFIL3MA0025.1chr20:33805038-33805049AGGTTACATAA-6.14
ONECUT3MA0757.1chr20:33805505-33805519GTAAAATCAATAAA+6.46
Enhancer Sequence
GTCAATGGAA AACAGCTGAC ACAGAGTGCG AAAGATCATG ACTAGACTAA ACACAAGATG 60
TCTTTCATCA GCCAACAGAC CTTGATTCTC CTGATAAAGA AAAGAAAAAC AGCACAGATT 120
CAGAAAACCA TCTTTAAGGC TGATTAGCTC ATATCAAATG TATAAATTAA ATATTTAGCT 180
TATAATATAT ACTGTGTGTC TGTGTATGTG TTGTTTAAGT TAAAAAGCTG AGACTATGGT 240
AGGTAGGCCC ACTGTAGATA ATATTCGACA GAAAACAAAA CGCCCACTTC TCACACACTG 300
AGGAATGAGG AAGCAGAGCG TCTCAGAAAA GTGCCCCCTG GGTGCAACTA GTTTAATTAA 360
TTTTTATGGA CTAGTCTAGA GAACTAACAT AAACAAGCAA TTTCGATCAT TTTGACTATT 420
TTCGACTGTT TTCTACCTTA TTTTTTTAAA TAATCACAAA ATACATTAAA TAGGTTGAAG 480
TAACGTTAGG TTACATAACG TTTTGCAGAA TGCTGAAGCT ATCCGACCCA AATCTTGAAT 540
AATAATCTCT TGTCATTCGT GTTCATTTAA TTGAATGAAT CTCTCTGTGT GCGTGTTTGT 600
GTAACGTTAC TTTTAAACAC ACTTTCAAAC TAATAAACTC CAGGCAGTCA AAAACCCACA 660
ACACTGACCT CTGGCGGAGA TGTTGAATGA AGGTCCATTT AGGCACACGG TTACATATAC 720
TGTAAGACAT TGTTCTTGTC AAAATAAATA CATATAAAAA CAAATAAAGA ATGAAAATGA 780
ACTTTAATTA AAGTCGACGG TAGTTCACTT CAACAAAATG AAAATCCAAA GTGCCCAAGT 840
TACCGTTTCC TCTGTCGTTG TTGTTGTCGG CTTGTTGCTA TGACGTCGTC AAACACCTGA 900
AGAGCGGAGA GACATGGACG TTACAATCTA TTGCAGCAGT CTATAATAAA GTAAGTAAAA 960
TCAATAAACC ACGACATATG ATGTAAAGAA ACCCATTAAA GCATATAGGA TACACATATA 1020
ACGTTATAGA GAGTAAAGAA AATATGAAGT AATGTGACGC GCGATACGAT GGCTTGATAA 1080
GTTAACTGTT ACTAAACGTA ACAGCTTTTG ATTCATTTAA TATAAAAACA GATTACTAAC 1140
GTTAGATGTG TAACGTTACT TCTGTTCACA GACACATACC ATGTCATCTG ACTTAATTGT 1200
GTCCAACCTG CCATTAGTGG 1220