EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-23104 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:33430489-33431981 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr20:33430617-33430628GAGCCATAAAA+6.14
NKX2-5MA0063.2chr20:33430511-33430521ACCACTTGAG+6.02
RXRGMA0856.1chr20:33431400-33431414TCAACTTTGACCTC-6.18
RarbMA0857.1chr20:33431031-33431047CAGGGTCAAGAGGTGA+6.16
RargMA0859.1chr20:33431032-33431048AGGGTCAAGAGGTGAC+6.09
Stat4MA0518.1chr20:33431077-33431091TTATTTCCTGGAAG-6.57
ZNF384MA1125.1chr20:33431607-33431619AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:33431608-33431620AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:33431609-33431621AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:33431610-33431622AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:33431611-33431623AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr20:33431614-33431626AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:33431604-33431616ACTAAAAAAAAA+6.32
ZNF384MA1125.1chr20:33431606-33431618TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
TGATTTGCGG TCCATGATTA AAACCACTTG AGATCAATGA CATGGTTTAT TACGTTGATC 60
TGCAGCAGCA CCTCCGACCG GCTCGAGTGT GGATCATACA TGGTAACTAA TCCCAGACTC 120
TCACTCTTGA GCCATAAAAC CATACTTCCG CTCACTAACC CTGAATCACT CGCTTGCTTT 180
GTTGACGCGT ACCTGTTGAT GATGCGGTTC AAGCACAAAA AAGCAACTAT GAAACAAGGA 240
TTAGACGTAG CTTGTGTCTA TAACACGAGA TTTACCGAGA GCGGCGTTTG TGTGTCAGAA 300
TTGGAGGCAT GTGTTGGTGC AGCGATGGGG CGGGTTTATG GTCGCTGCGA GCGTTTGATG 360
TGCTGTAATG AGGAAGTGAG TGACTTCCTG TGGTTAACGG GAGCGAGAGA GATGGATGAC 420
GGGGGAGGCC GTAAATGAAA AGCAGCAGTA GCGCAGTTAA CAGAGGCCGG GGTGTGCGGG 480
TTAAACGTTT TTCAAATGTT TTAACTGCGT TCTCTCCGAC ACGACGGGGG GCGAGGATAT 540
GTCAGGGTCA AGAGGTGACA GGCGAGATGT GTGCACTTCT ACATGTCATT ATTTCCTGGA 600
AGATGGGGTG CACTTGGTTT AGTTATGCGG GCCTGGATCC AGATGGCTGT AGTTGGAAAC 660
TTTTGGAGTC CATTTAACTT TTACTGTCAT CGTAAGCTTT GTGTTGAGTT CACGGGCTTT 720
GAGATGCCAA AGATGGAAGT GTTCAAGCGC TTAAGATACA ATTTAAAGGT AAATATGAAT 780
TTATATGAAT GGTATTAAGT TCCAGGTTCC TGAAATTTTC AAAAAATGCC GCGCCATCTC 840
ATTGGTTGCT GTCAAGAGAG CCCAATCATT ATCGTCTTGC CTGAACACCG TTTGCTTTTG 900
TATGTGTCAT TTCAACTTTG ACCTCTCTGT TGGGAGCTGT GACCTTTCAG CAGGCCCACA 960
CAGAATCATC ACAACTCCTT GGCCCTTGTG TGTTCTGATA CTTTATAATC TGATCATACT 1020
TCCTAATGCA GATAAGTATA TGATATTCAC TTGATGTACT TTTAAACTGA TTAGATTTAT 1080
TTCACAAATA ATTTCCCAAA ACTGCACCAG AAAATACTAA AAAAAAAAAA AAAAAAACTA 1140
GTCGCCAAAT AAAAAGTAAT GCTTTCCAGA ATTGATTTTA TTGTGATTCA ATAAATGTGA 1200
TTCAAAAGCT CTGAATTCAG AAAACCTACG ATTTGATTTT CTGCATACAA CAAACTGAAA 1260
GATAAATTAA AACAGGTATT CATCGGACTG ATTCCAAATT TAACTCCTGA AATGACTAGT 1320
AATTTTTACC AACAACAATT CACTTAAAGG TTTGTTTCAG AAGAACCAGA CTGCATGGAT 1380
TGTTTTTGAC TTACTAAAAC GAACCAAGTT CATAAGATTG ACTTGCTCGT GAATTACACT 1440
ACACTAGTTG TTCATTTTTG ATTCACAATA AGAGACCGCC AAGAGTCATG TG 1492