EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-22871 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:28842485-28843171 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr20:28842653-28842663CCTAATTAAA+6.02
MEF2AMA0052.3chr20:28842899-28842911TTTATTTTTAGA-6.07
PHOX2AMA0713.1chr20:28843062-28843073TAATTGGATTA-6.02
POU1F1MA0784.1chr20:28842833-28842847TTCATTTGCATAAC-6.15
POU2F2MA0507.1chr20:28842833-28842846TTCATTTGCATAA+6.67
POU3F1MA0786.1chr20:28842834-28842846TCATTTGCATAA-6.52
POU3F2MA0787.1chr20:28842834-28842846TCATTTGCATAA-6.52
Phox2bMA0681.1chr20:28843062-28843073TAATTGGATTA-6.02
Pou2f3MA0627.1chr20:28842832-28842848TTTCATTTGCATAACT-6.18
SOX15MA1152.1chr20:28842718-28842728CTATTGTTTT+6.02
ZNF384MA1125.1chr20:28843152-28843164AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:28843153-28843165AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:28843154-28843166AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:28843149-28843161ACTAAAAAAAAA+6.32
ZNF384MA1125.1chr20:28843151-28843163TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
TTTAAGATAA CAGCCATATA ATGCATGCAC GCTGTTATGA TTTAGCCTTG ACTAGGTACT 60
ACTGAGGTCA ATAATATTTT GGTGTGATGG AACCCCCTAA GGAAGCATGA AGGGAAGTAG 120
ACTCAAGCTA ATGAAAGCTT TAGGTCATAG CACTTGCCAT GGACAGGGCC TAATTAAAGC 180
TCAGCCTTTA TCTAGGCCTG AAGTCCTGCT GCTGCCGCTG TTTCATTTAG CTGCTATTGT 240
TTTCGTGATG TCCTCTGTGA CAAACAAGTG GAGCTGCAGG AGAGATGCCA CTGCGCCCTG 300
GGGACACTCA TTTACTACAG AGTTCACTAC CTAGAGTGCT TCTTTTGTTT CATTTGCATA 360
ACTGCGCAAG CCGCTGAACC ACATTTTTCA TAAGCTTGAC ATGACACCAT AAACTTTATT 420
TTTAGAGCCA ACAAAAATCT GTTCAACACC AATAAAATGG TCAATTTGCA TTATCAGAGA 480
ATTCACAAGA GGACGGCAAA AAGTGTTTTG ATCTCCAGCT ACCTCAACAT TGTGATACAA 540
GTCACGATGC AATACATTGT GATGGATCAC AATATCATAA TTGGATTATG TTTGAAACTG 600
TGCCAACTGT GCAACTGAGA GCCAGCATGT CTGCTTTCGA TTTCTTTTCG GCTTCTTGGA 660
GTGCACTAAA AAAAAAAAAA ACTAGA 686