EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-22861 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:28737592-28739374 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT-6.02
GLI2MA0734.2chr20:28739069-28739084CGGCGTGGGTGGTCG-7.42
GLI3MA1491.1chr20:28739069-28739084CGGCGTGGGTGGTCG-7.51
MSCMA0665.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT-6.02
MafbMA0117.2chr20:28738370-28738382AATATGCTGACT+6.52
RREB1MA0073.1chr20:28739189-28739209TGGGTGGGGGTTTTGGGGGT-6.06
RREB1MA0073.1chr20:28739187-28739207AGTGGGTGGGGGTTTTGGGG-6.73
STAT1MA0137.3chr20:28738174-28738185TTTCCTAGAAA-6.14
Tcf21MA0832.1chr20:28738444-28738458ATAACAGCTGTTAG-6.59
Tcf21MA0832.1chr20:28738444-28738458ATAACAGCTGTTAG+6.61
ZIC1MA0696.1chr20:28739018-28739032CTCAGCGGGGGGTT-6.03
ZIC3MA0697.1chr20:28739017-28739032ACTCAGCGGGGGGTT-6.33
ZIC4MA0751.1chr20:28739017-28739032ACTCAGCGGGGGGTT-6.1
ZNF384MA1125.1chr20:28738554-28738566TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TTTAATAAGG TTTTGTTCGT TTTGGCAGGT TTTGGACAGC TTTTGGGCTG GAAAAAGTCA 60
ACTAGCCTAT ATCTGGCAAC ACTGTGCTCA AGTGTCACAA TTCGCGCCAA TTCTAACATG 120
TCAGAAAACA ATTGGCTACA GTAAAACAGG TTGTAAACAA TTTTTTCTGG TATAATAGCC 180
TGCGATTTTA CACGAGGTCT AAGTGCTTTA GCCCTTTTAA TGGCTTAAAA TCGGTAAGGT 240
TCCTTAGGTG TCATTTGCTT TGACCGGGGA GGAATTCAGC TTTCCACACG TCTAATTGGT 300
AGCTCAGAAA GCGATTTAAT CGACCAGTCA TAAATGGAGT CAACAAAAAC AGACTGGTTT 360
TTAGATTCAG ATAACAAAGC AGGTATGTCG ACATACACAA CTTTCTATAC AGCTACATGT 420
ATTTCTTTTA AAAACAATAA CACATAGAAG TAGCTTACTT ACTACCCGTT TTAGTATTAG 480
AGCTCGTAAG CGAATGACGC ATTACAAAAC ATTACTCGAC CAAATAAAAC CATCAATAAA 540
TACAAACATG AACTCAAATG GTCTTAAAAC ATCACCAAAA ACTTTCCTAG AAAATTTTAA 600
GATGGTTTTT ATCATCGACT TATCTCAATT TAAAGAAATG GAAAGTGTCT TAGTTGCTCA 660
AAACATATAA AGAAATATAG CCTACACACA TTTGGTGTCC ATTGCTGTGT ATCAACTGCA 720
CGAGTTCCAC AGACACATAC ACAAACATAA AAGACTCAAT CGTCTGCTCT TCTTAAACAA 780
TATGCTGACT TATTTTCAGT AACCCTGGAT TGCTTTTCCA CACCGTCCAC ACGAGGAGCG 840
GCGCGCGCGC TCATAACAGC TGTTAGTGAT CAACACCAGC GAACCTAAAG GTAGAAATGT 900
TATTAATTTG CGCGTGGGCA TGATTTTCTA GAGCCGCATT GCACTACAAA CATGTGCAGC 960
TATTTAAAAA AAAAGACAAA CAGCTGCTTT CAGAGCGCAA TTCCCGCAGG AGCACCGGTC 1020
CCAATTCACA CAGCACTCCA CAGAGCGCGA TGCCGAATAT AGAGGCAGAA AAACCCTGTC 1080
ACTGAAAGAC ACGCGCGCGC ACAGCAGGGA GCGCGAGGCG ACAGGATGAT TCACTTCAAA 1140
CTCACCAGCA CTTCGGGAGC CACTCGAATC CAGCACTGGA CATGACAATT GATCACTCCT 1200
GCGGGTCCGA ATATTGCTAT AAGTTTACAG CAGCACAATC ACACACAAAC AACTGCTGAC 1260
TGAAAGAGCG CAATACCTTT GTAAGTACCG CCTCGTCCAC TCCCGAAGCT CGATTTCCTC 1320
CTCCTTAGCA ACCAGAAAAG AGCAGGTTCA TGATCTAACT GGCGAGAAGG GTCTGGGATG 1380
AGGAGGATGA TGATGGGGTG TTGGTGAGGA AAAAATGATG AAGAGACTCA GCGGGGGGTT 1440
TCTTCCACTC TGTCCGCCTC TCTCGCGCAC TGGAGACCGG CGTGGGTGGT CGCTGCGTGG 1500
ACTGGAGTGG AGTGTTCAGG TACAGTGTGA GGAAGGATCC TGGCATGTGT GCAGCTGAGT 1560
GTGAGAGAGT GTCAGAAACA GGGAGGGAGG ATAACAGTGG GTGGGGGTTT TGGGGGTGGA 1620
GTGTCTCCCT CTGTATTTCT GGCAAGCTAT TCTGAAACAT GTATTTGTTT GATAAGAGAG 1680
TTTTTGCAGA CAGATCAATT TAAATTTGGT CATGTGGTTA CAGTCAATTG AGTAATCCCC 1740
TCTAATCCCT GTATTTGTCT CATTAGTACA TCTATAAAAC AT 1782