EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-22766 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:26600648-26601817 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX1MA0070.1chr20:26601047-26601059CGATCAATCAAA+6.18
RARA(var.2)MA0730.1chr20:26601524-26601541TGACCTTGAGATGACCA-6.22
Rarb(var.2)MA0858.1chr20:26601524-26601541TGACCTTGAGATGACCA-6.34
Enhancer Sequence
CTCCTCCTCC TTACCCTTTA TAGGGTGGTA CAGCAGCCTA GTGGTTTGCA ATGTTGTCTC 60
ACAGCAAGAA TGTCACTGTT TCAGGTGACG GTTTCCTCCC ACATTCCAAA GATATGCGCA 120
TAAAGAACAC CACACAGAGA GCACAACGAG AAGCAGCCAG AGAAGACTGT ATTGTCCCAC 180
TCTGGAAAAG GGCCTTTGGT CAGGGTGCCT TTTCAATGCT GAGTTTTTTT CCCATACAGT 240
GTGCGGGATC AAATTTAAGC AAACAATCTT CCATCCAGAG GATCACATGC TTCTGATTGA 300
TCACGGCTGG TCGCGCATTA ACTAATGTAT GATTCACCAA TCAGATGATT TCTAGCTCAC 360
TATAAATAAC CAGTTATTTT ATTTAGTGAA TCAGTGAATC GATCAATCAA AATTGTCACT 420
ACAGTCGAGC TCTTAACCAG CAGTATATCT CTATATAGCC ATTTCTAATT TGTCATTAGC 480
TCTAAATAAA AGGGGCGTTC TCAAGCCCTA CCTGAGCTCA AACATCCATC TCGCCCTGGA 540
AATAGGAGGA AGCCCTGGGC TCGAGGATCT TATAGGCTTA GGGCTCTCTC CCAGGACAGC 600
ATGCCAAACT CACTTTATAA TCAATCATCA GCTAAATGTG AACTCTTGAA ATGTATATTT 660
CGGTGGATTG AATGTTTAGG AATGAAAATT AAGAAAACAA GAGAGCACAT GAACTGCAGC 720
CAATCGTCCC ATAAACCTGA ATACTGACTT AAGCAACCTT AAAATAATTT CAAGCATAAA 780
AAACACTGAA AGCACGAGAT GGTCCTGCAG TTGGAGTTAT CTGCAGTAAT TCTGCTTGAG 840
CTGTGAATCA GGCTGTTCTC CTGGAGGCAG TTCTCCTGAC CTTGAGATGA CCAGGTGTTG 900
TAAAAAGTAA ACCACCTCCT GAATGAAACT CCCTGTAGAC GAGTACACAT GGCCGGGCCT 960
TGTGTCATGC TCACACAGGT CAGCTCAGAT TTACAGCTGT GAGGCGGGAG TATGTTATTG 1020
CCCTTCAGGA ACTTTCAGAG AATTCGGAGT ATCACGCTAT CTATCAGTCT GAGGCATGTG 1080
CAGGGCAGTC AGTTTGGTTT GGGTAGCCTA AAAGTAGTAG TATTCACTCT GGTATTCTTG 1140
AGCAGATCAG CGGCTTTCCT GTGAAGCAG 1169