EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-22691 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:24547195-24548377 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr20:24547589-24547606TGAACTAATTAATTAGG+6.16
FOXP1MA0481.2chr20:24547982-24547994TACTGTTTACAT-6.11
Foxj3MA0851.1chr20:24548330-24548347ATATTTGTTTACCTTTT-6.93
Lhx3MA0135.1chr20:24547591-24547604AACTAATTAATTA-6.22
ZNF384MA1125.1chr20:24548343-24548355TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr20:24548344-24548356TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr20:24548345-24548357TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr20:24548346-24548358TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr20:24548347-24548359TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr20:24548348-24548360TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr20:24548349-24548361TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr20:24548350-24548362TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr20:24548351-24548363TTTTTTTTTAAA-7.22
mix-aMA0621.1chr20:24547595-24547606AATTAATTAGG+6.32
mix-aMA0621.1chr20:24547592-24547603ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
ACGTGCCAAA TAATACACAG GGATGGATGA ATATGTGTCT ATTAAGATAA ATATGTAAAG 60
TTCCATTATT TGTCTGTCTG TTAAGCAGCA CTTTAACTAC TTTTGTGGTT TATGTGCTGC 120
TTTCCTAAGG TTACATTAGG CTAAATTCTT ATCACAGAAT GAGAAATAAA ATGTACAAAA 180
TGAGAATACT ATGAAAATGC TTTTACTACA TCTTATATAA CGGGTTAAGT TTTTACTGTC 240
ATCTGTTTGC GTTGCTTAGC AACGCTAGTA AACAAAGGAA AGACGGCGTG CATGTAAATA 300
TCTACGTGCG ATCCGCTAGG CCACGGATTC TCAATCCTGT TCTTGGAGAT CCACCTTCCT 360
GCAGATTTCA GTTGGTACCC ATATCAAACA CACCTGAACT AATTAATTAG GACCTGCACA 420
CCACTTGATA ATTACAGGCA GATGTGTTTG ATATGGGTAC CAACTGAAAT CTGCAGGAAG 480
GTAGATCTCC AGGAACAGGA TTGAGCACCC CTGCGCTAGG CCAAAGGCCT TTATGTATGG 540
CGCCCTCTGG TTTCCCGTAT GAATGAAATG GGCATGAAGC TCTAAGTTCA TCGCCTCAGT 600
ATGGGTAAAA ATGGTAAAAT ATCAAGTAAA GACATGAGAA TCCATCAATA TTTCATCAAA 660
TCTGGAGACT AACAGAAAAA AATGCATACT TTTGGGATAA AAGTCAAGAG TTTATTTAGT 720
GACAAACGAC TGCATTTCTT TATAAAGCAT ATAACGTTAA GGGGTCAAAC GTTACAAACT 780
GAATTATTAC TGTTTACATG GCAAAATAAC GAACAGGAGG TATAAAATGC GAGTAAATTA 840
GACTGAGGAC AAAATTCGTC ACACACCATC CGGTATAGTT CCCTCACAAG ACTAATTTAA 900
TAGTAATGCT TAATAACGAT TTATTCGTTT CTCAAAAACA ATTAGTTCAT AATATATCTG 960
TCTGAATATA GCCAATTTAA GCACTCGTAC GCATTTTTTT AACATTTAAT TGAAAATTTA 1020
CCTCAGAAAT CGTTCCTAAT GCGAGACCCA ATGTGCGGAC CATCGGACCG GATGATTAAG 1080
GACAGGTTAT GGAAAATCCC AGCGGTCTCA TTGGCCAGCT CTTATGTTTA CGTTAATATT 1140
TGTTTACCTT TTTTTTTTTT TTTTTAAAGA AATACCAAGG TA 1182