EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-22507 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:20003713-20004864 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr20:20003998-20004015AACATTAATTAATTTAT-6.01
ArxMA0874.1chr20:20003887-20003904CAACATTAATTAATTCA+6.19
ArxMA0874.1chr20:20003888-20003905AACATTAATTAATTCAT-6.42
Lhx3MA0135.1chr20:20004000-20004013CATTAATTAATTT-6.54
POU6F1MA0628.1chr20:20003891-20003901ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20004001-20004011ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20003891-20003901ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20004001-20004011ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TAAAATTTAA TCTTGATGGT CCAGGATCAA CATTAGTGAA TTAAAATTTT TGATGGTCCA 60
GGATCAACAT CAGTAAATTT ATAATCTTGA TGGTCCAGTA TAAACATTAG TGAATTTTAG 120
GCTTGATGGT CCAGGATCAA CATCAGTGAA TTTATAAACT TGATGGTCCA GGATCAACAT 180
TAATTAATTC ATAATCTTGA TGGTCCAGGA TCAACATGAG TGAATTTAAA ACTTGATGGT 240
CCAGGATCAA CATCAGTGAA TTTATAAACT TGATGGTCCA GGATCAACAT TAATTAATTT 300
ATAATCTTGA TGGTCCAGGA TCAACATTAG TGAATTTATA AACTTGACGG TCCAGGATCA 360
ACATTAGTGA ATTTATAAAC TTGATGGTCC AGGATCAACA TTAGTGAATT TAAATTCTTG 420
ATGGTCCAGG ATCAACATTA GTGAATTTAT AAACTTAATG GTCCAGGATC AACATTAGTG 480
AATTTAGAAT CTCGATGGTC CACTATCAAC ATTAGTGAAT TTATAAACTT GATGGTCCAG 540
GATCAACATT AATGAATTTA TAATCTTGAT GGACCAGGAC CAACATTAGT AAATTTTTAA 600
ACTTGATGGT CCAGGATCAA CATTAGTGAA TTTTAATCTT GATGGTCCTG GATCAATATC 660
AGTTAATTTC TAATCTTTAT GGTCCAGGAT CAACATTAGT GAATTTCTCA TTTTGATGGT 720
CCAGGATCAA CATTAGTGAA TTTTTTACCT TGATGGTCTA GGATCAACAT TGAGTTTATA 780
AACTTAATGG TCCAGGTTCA ACTTCAGTGA ATTTATAAAC TTGATGATCC AGGATCAACA 840
TCAGTGAATT TATAAACTTG ATGGTCCAGG ATCAACATTA GTAAATTTAT AAACTAGATG 900
GTCCAGGATC AACATTAGTA AATTTATAAT CTCGATGGTC CAGGATCAAC ATTAGTGAAT 960
TTAAAATCTT GATGGTCCAG GATCAACATT AGTGAATTTA AAATCTTGAT GGTCCAGGAT 1020
CAACATTAGT AAAATTTAAT CCTGATGGTC CAGGATCTGT CAGGGTTCTT AAAGAGACAC 1080
AAATGCAGGC TTGAGAGAAT CAGGGGAATT TAATTTCAAT ATCCAAACAA AATATCTTTC 1140
TAGAAAAAGA T 1151