EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-22009 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr20:2360453-2361317 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NHLH1MA0048.2chr20:2361113-2361123CGCAGCTGCG+6.02
NHLH1MA0048.2chr20:2361113-2361123CGCAGCTGCG-6.02
NR2F1MA0017.2chr20:2361136-2361149CTTGTGACCTCTG-6
POU4F1MA0790.1chr20:2361041-2361055ATGAATTATTCATG+6.51
POU4F1MA0790.1chr20:2361040-2361054CATGAATTATTCAT-7.1
POU4F3MA0791.1chr20:2361038-2361054GACATGAATTATTCAT-6.44
POU4F3MA0791.1chr20:2361041-2361057ATGAATTATTCATGAG+7.21
RFX2MA0600.2chr20:2360818-2360834GGTTGCTATGGAGACG-6.08
RFX2MA0600.2chr20:2360818-2360834GGTTGCTATGGAGACG+6.29
RFX3MA0798.1chr20:2360818-2360834GGTTGCTATGGAGACG-6.2
RFX3MA0798.1chr20:2360818-2360834GGTTGCTATGGAGACG+6.37
Enhancer Sequence
TCAGCAAGGA CCACAGATTC CGAATATTTA GCATGATTAA GCATGATTTT CCACAGAGTC 60
ATCTTTTTTA AATGAGGACT AAAATTGACA TATTAAAGGG CCTGTGGAGG GGGGCTCAAA 120
ATCAGCCAGT TATTATCTAC AATTAAAGCT AACAGGTGCT AAAGTTGTCT TAATTGACGT 180
TTAACACACA CAAAGCTGTT ATAATCTCAG AAAATCAAGG CTTTCCTGAC CCTTTCAACA 240
TCACGCATTA TCAAGCAGCA CGAGTCTGCG GTCGGTGTTT GACAGTTCAG AGACAAACTC 300
TCCCTCGTGT CTTTCCTTTA CCCCCCCTCT CTGAAGTGCA GCCTGCTGCC CCTTCTGGTT 360
ACTGGGGTTG CTATGGAGAC GGTCAGTTCC TGGTTACGCA TGCAGTTTGT GTCATGTCAA 420
CTCAGCAGCA ATAAAAGAAG GTCAAAGCGA GAGGGAAGTG TTGAATACAC AGAGGAGGGA 480
ACGCACAGAC ACACACACAC AGCACCCGCT GGGCTGGAAC AAATTGCCCT CATTTAGGGG 540
TTTTAAATAA ACTGGAAACA TCCCTGAATG CACTCGCTCT AGTGAGACAT GAATTATTCA 600
TGAGGCGTTT AAGCAGGTTT GTAGATGCAG GGTCAACCGA TTCAGAAGGG TTTCTGCAGT 660
CGCAGCTGCG CAACAACGAC CGGCTTGTGA CCTCTGCGCA TCACACACAC ACACACACAC 720
ACCCTCAACT GAGCATGCAG GAGCCACGCG CTTTGGGCTG CATGACACTG GAAAACTGAC 780
ATTGTGATGT TTTATTTTTT GCAATATGTA AAGTTGAAGT CAGAATTATT AACCACCCTG 840
TTTATTTTTT CCCCCAGTTT CTGT 864