EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-21388 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr2:42386292-42387496 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr2:42386476-42386486GTCACGTGAT-6.02
FOXF2MA0030.1chr2:42387400-42387414AATGTTTACGTTTA-6.58
IRF2MA0051.1chr2:42386663-42386681GGAAAGTGAAACTTAGGC+6.34
LMX1BMA0703.2chr2:42386595-42386606TTAATTAAAAT-6.62
MITFMA0620.2chr2:42386472-42386490TAAAGTCACGTGATTTGG+6.26
MITFMA0620.2chr2:42386472-42386490TAAAGTCACGTGATTTGG-6.26
SREBF2(var.2)MA0828.1chr2:42386476-42386486GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr2:42386476-42386486GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr2:42386476-42386486GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
GTACTCAGCG AATTGTATTA GTTATCAAAC TCACTGAACA CTATTGATTT GATAAGCAGT 60
TCGATCCAAG TTACAAAACT TTTCGTCTTA TTTTGTTGTT GGAGCTGTAT ACCTTCTTCG 120
GAGATAAACA TTTACCAGGG ATAAACAGTT TTATGTAGTG ATAGAAGAAT GGAACTACTT 180
TAAAGTCACG TGATTTGGTT TAAAAGCGCT TTCAGTACTA ACTGAACGTT TATTAAAAAT 240
ACTGCACAAA CATAAGATCT CTTAAACCGT TTTTGTGTCT AGTCACTTTA TATTATGAGT 300
CAGTTAATTA AAATTTACAT ATGTTAATCC AGACACACCC GTTTTGCCGA ACCAGGAAGC 360
TCTGCAGTTT AGGAAAGTGA AACTTAGGCC GCATTATTTG CCTTTCAGTC GTTGTTGAGG 420
CTAACGTTAC CTGTGAGAAC GCACAAAATG GCTGAATCCA GTGTTTCTTT GGCTCAAGAT 480
CAGTTCAACT GTTCAATCTG TCTGGATCTA CTGAAGGATC CAGTGGCCAT TCCCTGTGGA 540
CACAGTTACT GTATGTGCTG TATTTCAGGT TATTGGGATC AGGATGAGCA GAAGGGAGTC 600
TACAGCTGCC CTCAGTGCAG ACAGACCTTC ACTCCAAGAC CTGCATTAGG GAAAAATACC 660
ATGCTGGTTG AAGTGGTGGA GAAACTCAGG AAGAGAAAAC TACAAGCTGC TCGTCCTGCT 720
CAGTGTTACT CTGAATCTGC AGATGTGGAG TGTGATGTTT GTACTGGAGA CAAAAACAAA 780
GCCACCAAGT CCTGTCTGAT GTGTCTGAAC TCTTACTGCC AAAATCATCT TGAACAACAT 840
GAGACTTTCT TTAAAATTAA AAGACACAAT CTGATGGACG CCACTGGACG ACTGCAGGAG 900
ATGATCTGTC CTCAACATGA GAAACTACTA GGTATTTTTT GTCGTACTGA TAAGCGCTGT 960
ATTTGTTATC TGTGTACAAT GGATGAACAC AAAACCCACG ACACTGTATC AGCTGCAGCA 1020
GAGAGGACTG ACAAACAGGT ATGAAGTAAA AGCACACCGT TTTAGCTTAC TTGTGCTGCT 1080
TTAATGCTTT TTTAAACAGT GCCACAGCAA TGTTTACGTT TAGTTTTTCT GGACTGTAAG 1140
GTAGATGAGA ATCAACACAC GACAGCTCTG TTGTGCCTTT GCATAAATGG ATAAATAGTT 1200
GTAA 1204