EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-21287 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr2:39772765-39773527 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr2:39773482-39773495TAATTAATTATTC+7.12
POU3F2MA0787.1chr2:39772772-39772784GTATGCAAATTA+6.04
POU4F1MA0790.1chr2:39773483-39773497AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr2:39773481-39773497GTAATTAATTATTCAT-7.86
POU4F3MA0791.1chr2:39773481-39773497GTAATTAATTATTCAT-7.73
Pou2f3MA0627.1chr2:39772770-39772786GTGTATGCAAATTAAT+6.95
RREB1MA0073.1chr2:39773391-39773411CCACCACCCAACCCAGCCCC+6.02
RREB1MA0073.1chr2:39773384-39773404ACCACAACCACCACCCAACC+6.3
RREB1MA0073.1chr2:39773396-39773416ACCCAACCCAGCCCCACCCA+7.1
Enhancer Sequence
GGTATGTGTA TGCAAATTAA TGTTAGGTGC ATTTTAATAG ATTTAAGAGT GCTTGCATTG 60
TATTAACAGC CTTCAGCCAG ACATCGGTGT GAACATTTTA TCTATTGGAC TAGAGCAATA 120
TAAAAGCCTG TGCTCGGTGC ACAAAATATG CCCCAGCAAA ACACGAAAGA GAGCATAAGA 180
CAATGGCAAT TGGAGATGAA GGTATTTGTG TGTGTTTCTA ACAGTACAGT ATAAAACATC 240
AGTGTTTTCT TAAGTTAAAC AAACCAAAAT AAGTCTATTG AGCTAGAGTA GAAGCTCTAG 300
AGAGGATAAG AGTCCTAAGG CAACTGACTG GTGAAGTGGG AGGGGGGATG ACAGATCGGT 360
ACAAGAGAGT AAGAGAGAGA GAGTGTGTCT CTGACGAGTA CTCACAGGGG AGGGGCAAAG 420
CTCCTCTCCT CACAGCTGCA GGACGAAGCC TGCAGATATG GGGGGCAGAG CAGGCTGGCT 480
CACAGACCCT CACGCAGGGT GAAAGCTACA GTAAAGGCCT AAAATAGACA CAGGCTTTTC 540
TGTACCAAAA TCACAAGCAG GAGTCCACAT GCCCCTCAGA GTCAAGTCAA ACCCATGAGG 600
GAGTGGAACA CGTCAATAAA CCACAACCAC CACCCAACCC AGCCCCACCC ACCAATTACA 660
ACAAATAATG ACCATTTCTT CATTTAAAGT GTCATTCACC CAAAAATTCA AATTCTGTAA 720
TTAATTATTC ATTTTTGTGT CAGTTCAAAA CAATAAGTCC TC 762