EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-21147 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr2:35952922-35954228 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr2:35953721-35953732TTTGACCTTGA-6.14
Foxq1MA0040.1chr2:35953386-35953397AATAAACAATA-6.62
HNF4GMA0484.1chr2:35953716-35953731TGAACTTTGACCTTG-6.66
Hnf4aMA0114.3chr2:35953714-35953730GTTGAACTTTGACCTT-7.24
NR2C2MA0504.1chr2:35953716-35953731TGAACTTTGACCTTG-6.37
Nr2f6MA0677.1chr2:35953716-35953730TGAACTTTGACCTT-6.79
RARAMA0729.1chr2:35953611-35953629CCATGATCTTTTGAACTT-6.34
RXRBMA0855.1chr2:35953716-35953730TGAACTTTGACCTT-6.98
RXRGMA0856.1chr2:35953716-35953730TGAACTTTGACCTT-7.06
RarbMA0857.1chr2:35953614-35953630TGATCTTTTGAACTTT-6.41
RargMA0859.1chr2:35953613-35953629ATGATCTTTTGAACTT-6.29
RxraMA0512.2chr2:35953716-35953730TGAACTTTGACCTT-7.06
Sox1MA0870.1chr2:35953390-35953405AACAATAGCATTTTT+6.13
Enhancer Sequence
TTGGAAGGCC TGCAGGATAT ACGAGCAACT ACTGGATTAA AGTGTATTTG GAAAATACCA 60
TTGACTCGCT GTTGTACTGT CTAAATGTTT TCTGGAAAAT GTCCTTGTGC ATGCATGGGA 120
ATATTGTCTT ATTTCATAAG CATGACTGTC ATCAATTTTA GCCTTTTTCC AAGAGCCTGT 180
GCAAAGAGGT GATTCATTTT TTCCCTTGTT TTTTGGAGTT CACCCAAAAT CTAATATTCT 240
GTCATCTTTT ATTCACTTTG TCAGATCATT TAGTCACATT TGTCTTTCCA AACTTATTTT 300
GACTTTGTAC ATTAAAAGAT GGGTTTTTAA AGAATATTTC TGCAGTTTTC CTGTCAATGG 360
AGATAAAAAC AGTCAGTTTT ATGCACAAAA ACACTAAACA TAAACATATA TTTTGCATTT 420
TGGCTTTAAA AAAAGGCATA CAGGTTTGTA ACAACATGAA GGCGAATAAA CAATAGCATT 480
TTTAGGAGTG AAGTTTTACA CCTTGTACAT TTGTTCTTAG TATCTTTAAA ATTATAATGT 540
TCATTTTTTT TAAGCGTCTT TTTTAATAAA AATGATTTAG TGAATGAACT GAATAAATAT 600
TGTATTCCTC TTGTGTAACT TTAAAGTTGC AGAAAAAAAT CACTGATTCG ATTTTTGGGG 660
GGAATTTTAA AGTTTTGTGC TTTTATGTTC CATGATCTTT TGAACTTTGT CTTTGTAAAG 720
GAATTTTCAG CTTATTCAGT GTTAGAAAAG CAGAAAGACT ACACCCTATT GTAAAAAATC 780
TCTCCCAGTT CTGTTGAACT TTGACCTTGA CCACCTGATG TGTGCTGTGA GCTCCTAAAA 840
GTCAGTAAGT TCAGTTTCAT GTTGAAGAGC ATAATGCCCT CAGACGCTGC CGCAAGGAGT 900
CTCTTTTGTC ATTGCTTTAA ATCAGTCCCT GCTTTAGCTG CAGTTTAACT TTTGATGTAA 960
TCTCTCAGTG TATTTACTTA ACACACAGTT GTCCCTAGTT TTTGCAGATT TGTTTGGAGA 1020
GCAAATTCTT TGCTAAAGCA AACATTGGTC CCCCCTGTGG TCCTGCTGAA AGATGGTGTC 1080
ATTTTCTTCA CACTGAATAA ATGATGTCTC TCCATACCAT TTCCATTTGG CCCCTGGTTA 1140
CAGTCTCTCC CAAACACACT TGGCTTGCTC AGACATGCGA AAGTAGGTTT ATGCATGCTC 1200
TGTATGATGA CTGGAGGATC TTAGCAGAGC TGTTGAAATT CAGACTAGCA CTAAAAAAAA 1260
CCTCTTGTAA AAAGTGTGTA ATTATGTTCC TGTTGTCATT TTACAA 1306