EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-20686 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr2:25378820-25379872 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr2:25378862-25378875TAATAATTAATTA-6.18
Lhx3MA0135.1chr2:25378876-25378889AGATAATTAATTA-6.62
SPICMA0687.1chr2:25379611-25379625AAAATCAGGAAGTC+6.06
Enhancer Sequence
AGATTATAAA AAAAGTTTAA ATTAAATATT AAAAAGTTTA TGTAATAATT AATTATAGAT 60
AATTAATTAC AAAAAAATCT GTATGCACAT AAAATAATAA TGCTATTTAA AGGTAAAGCC 120
TATTTATAAA AGTGGCCATA TTTGAAGATG CACACTCATA TTTCCAGTAA CTTTTCTCCC 180
GTCAGCTGGG TGTCTGTAGC AGATCTGCGA GATTACCAAT TATTTCACCT GCCACCTTCA 240
GTCTTCACAC TTCTCCGGAT ACAACTGACA GTATGGATAT GTGATTATCT TCCTCTCTGA 300
CGTTACTCTC AAAACAGAGA TGAATGGGGC CTTTGTGTCT GGTGAAAGAA CGTGATTGAA 360
GCTTGTTAAA GTGCAGCAGT GAGAGTAAGA AGGCTCCATG CTGTGTTTCT CCTCCCGCTC 420
CTGCAGTCTC CATTTTGTGA GCGCCTGCAG AGAGGCGGCC ATGACTGTGC TCCAGTGACA 480
CCAACACAAA AGCACACTCT GCCTATGCCA TTCAACTGCT TGTGACCGGC ACAGACTCAC 540
TGCTGTGGGG ATGAAAGTGT TGTTTGTACA GGATTTAATG GCTGGGAGCG TTGTCCTCTG 600
GTAAAATGCA TTGCTTGCCT CTAGTGAAAC TCCCAGTGGA TCTGTCTCAT CAGTTATTAC 660
TGTAGTTACT CACACATACA GCTGCCGGTG TGTGCGTCTG TTAGAGAAAG GGAAACGTCT 720
TTCTCAGTCC TCAGGACCTT TTTCACAGTT AATGTGCGTT TGGTGTCTCT GCTGAACAAT 780
CCCTTCAGAA TAAAATCAGG AAGTCAGCAC AATGACATGC CTCACAGCTA CAGCTGCATT 840
CACACATCCC ACCTAGTAAA GTGATTTCAC ACTAGTCAAC AGCTTGTCTT TACTTATTAT 900
GTCTGATGTG GATTAAATGT TCTTTTTCAT CTGGTGAAAT TGTAATTGCA TCGTAATATT 960
TATCGCAGAA AAACGAAATA TAACAGTCTC ATTTTTTCAG CTTAACTAAT TTTGCTCCAG 1020
TGTCATTTTT GTTTACAGTG AAGTGCCTCC AA 1052