EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-20038 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr2:5262640-5264526 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ETV2MA0762.1chr2:5263676-5263687AACCGGAAACA+6.02
MEF2AMA0052.3chr2:5264242-5264254GCTATTTATAGC-6.32
MEF2BMA0660.1chr2:5264242-5264254GCTATTTATAGC-7.22
MEF2DMA0773.1chr2:5264242-5264254GCTATTTATAGC-6.32
NKX2-5MA0063.2chr2:5264448-5264458CTCAAGTGGT-6.02
POU1F1MA0784.1chr2:5263638-5263652CACATTTGCATATT-6.47
POU2F1MA0785.1chr2:5263640-5263652CATTTGCATATT-6.74
POU2F2MA0507.1chr2:5263638-5263651CACATTTGCATAT+6.64
POU3F3MA0788.1chr2:5263639-5263652ACATTTGCATATT-6.03
POU5F1MA1115.1chr2:5263640-5263651CATTTGCATAT-6.32
Pou2f3MA0627.1chr2:5263637-5263653TCACATTTGCATATTA-6.48
RARA(var.2)MA0730.1chr2:5262671-5262688TGAGCTCAGGTTGACCT-6.05
Rarb(var.2)MA0858.1chr2:5262671-5262688TGAGCTCAGGTTGACCT-6.7
Enhancer Sequence
GTTGTTCATC AAGATGACGA CAAGGTTTGT TTGAGCTCAG GTTGACCTCG TTATTACATG 60
TATATATTAT CACGGTGTAA TGTCTCGGCT GTGTTTTTAA AAATGGCGTT CCTTAGTTTT 120
CATTCTCCTA GCTTATGCAC GCGCTAGTGA CGTTTCTCTG TAAACCAATA GCATTCAGCT 180
GCACATCTCG CTCCACCTTT TGGTACTCTT TTAGTTGTGC TACCCTTTGG AAAAGGTTAA 240
AAAAAACAGT ACAGTACAGT TGCTTTTGGT GTCTTTTAAA AGTGAAAACA GAAATAAAAG 300
CATCCCGACC TGTACCGTAC CAACAATGAC TCTGTATATT GAAATACAGA AATGAAAATG 360
TAAATCGGCT GAATTTAAGC TAATTTAAAT GAGCAATTTT TTCAACTTAA TTTGTTTAAA 420
TTCAGCCCAT ATAAATCATT AGCAACCACT TATCTTAAAA ATGTATGCTA AAAACACACA 480
AAATCTTAAA ATCCAGCTCA CAAATGACTA AGCAAATACT TCAAGTGTGC ATTTCTGCAG 540
CTCGGCAAGG ACGCCGCAGA CAAACTGCAG AGCATCACGA CTTTGAAGTG GGATGTAGGT 600
CACACACACA TATCTCTAGC ATGAGTGCAC AGTTGCAAAC GTTGTGCTAA CACTGCTCAT 660
AAGCTGCAGT AGCAAATGAC TGCAGTGCAG GATGGAGGAG GGAAAAAAAA GCCATGCATG 720
AAAAAAAGGC ATGATCTAAG AACATCACTT TCAGAAATAG CACCGAAAGC TGCTCATAGG 780
TGCACTGTGC TATAGGTAAC TAAGATCAAG TCTAGTGTCC TGGCCAACTG CCACAGTGAA 840
TGGCCCAGAT CTGTACTGCC AGCATGAGGT CAGCGTTTCC ATGGAGAGGG GGACCAGCTG 900
AGTGCTAATC TGCTGTTGTT TATGCATCGG AAGAGGAAAG GAGGGGCAGC AGAGGATTGT 960
GGGAAGGGAA GGTGGGGGTG ACAGATCCCT GCTCGGCTCA CATTTGCATA TTAGAGCCTC 1020
GTGCTGCAGC AGAACAAACC GGAAACAGTT CAGGATCGCT CGCAGAAAAG GAGGTCGAGA 1080
CAATGGTACG GTAAATAAAC ACTAAAACTG CAGTAACAAA AGGTGTCATA GGCGGGCTAC 1140
AAGACAAATA AAAAGAAACC ACCCATTAAT CACTGGTTTT TCCGCATTCA ATACCAGTGG 1200
ATTCTATAGG CTTGGGTAAA AATGGAGGTG AGTGCAAAAC TTCATTGGCT CCACCCATTC 1260
AGTACTCTCC TCCTCCACCA GCACCACATG AATATTACCA ATGGGATAAT GCATTAAGCC 1320
CCTTCAAACC CCTCACGAAG AGCTCTTACT CTAATCCAGT GAGTGTCACT AAAGACCCTG 1380
TTTCCTGAGG ATCAGATTGT AATGTATTTG AGTGTTTTAG TGTTGTAGAC ACGTTTATGC 1440
GAGCACAAAA GTCCATTTCT CTGCATTAGG ACTCTGTTTA TCGCCCTTGG TTTGTGAAGG 1500
ATATTGCCTA ATAGGAACTA GTGGCTTTGT ATTTGGCGCC ACCCACTGAC TGAACATCCT 1560
CTTTACTGAA AATCAAAGTC TTTCCGCTGA GCTGCTCATG ACGCTATTTA TAGCTTTAAA 1620
CATTACCTAG TGGAGCAACC TGAGAAGTGG CCAGTTTGAG GACAACATTA CAAATGTATT 1680
AAACAGAGGA CAACGGAAGT ATTCTGAAAA TACGCATTTT GGAAATTTAG TTATGAAATA 1740
AAAATACAAG AATTTGATAT CAGTGATGGT TCACACAGAA AAGAAGGTGC AGTTAATTTT 1800
TACTTGCACT CAAGTGGTTC CAAACCCTTA AGAGTTTCTT CATTCTGTTG AACACTAAAG 1860
TAAATACACT ACCTGACAAC AGACTT 1886