EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-19693 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:44175936-44176776 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr19:44176336-44176355CGGCCAGCAGGTGGCGCAT+6.88
HNF1AMA0046.2chr19:44176298-44176313CGTAAATAATTAATT-6.01
HNF1BMA0153.2chr19:44176299-44176312GTAAATAATTAAT+6.42
Lhx3MA0135.1chr19:44176304-44176317TAATTAATTATAC+6.12
Lhx3MA0135.1chr19:44176301-44176314AAATAATTAATTA-6.71
POU4F1MA0790.1chr19:44176299-44176313GTAAATAATTAATT+6.11
POU4F2MA0683.1chr19:44176299-44176315GTAAATAATTAATTAT+6.06
POU4F3MA0791.1chr19:44176299-44176315GTAAATAATTAATTAT+6.15
Sox1MA0870.1chr19:44176142-44176157TGCAATGCTATTGTT-6.59
Enhancer Sequence
GAAATTCATT AAATAAATAC ATAATTTCAG CATTTGATGA TTATTACATT CCATGAAGTT 60
TTATAATGTT TACACCATTC AAAGAGTCTT GATTTAAGGT ACAATAGCCA GCACTTATTT 120
TTGTAGCTAT AAGAATATAT ATCAATCATT AGAACAGTTT GTGATCAATG ATAGATTTGT 180
ATATGATGTT GATCATGCTA AATAAATGCA ATGCTATTGT TTACAGTTCA GTTACATGTC 240
CCTTTTGCTT TTTTATCGCA TATTTGGACT TTTATATGAA GTTAAACATT TAAATTTCCA 300
TTATTTAAAT ATATCCTGTC ATAATTTGAA TGGATACCAC GAGTGCACTA CTATTTACAC 360
ACCGTAAATA ATTAATTATA CGGTTATTAC ATTACACAGG CGGCCAGCAG GTGGCGCATT 420
ACATCCTTTA TAAATGCCAG AATTACAATA AAAACTCTCG TTTTTTACAA CTAATGGTGC 480
TTATAGTTTT AATGTTGTAA ATCTTAAATG TATACAGGCC AATAACTATA AGAGATATAA 540
GAATACAGGC GCTGCTTTTG TCTGATAGTC TCTGACAGGC GCTTTTGATT TACCTCAGCA 600
TTCTTTGAGA GCAGAAAATG ACCCGGATGC AGTTTGCTGA ATGCGGCAAG ATGACGTCCG 660
CGCTTATTTA CATGTGTGAC ACTGAGGGAA GCTTCAAGAA TGGCTTTTAA CCCTTACTGT 720
GTTTTTAAAC CTTCGATTTA GTGCGTAAAT TTAACTTGTA TATCGATTCT AGAATCAAGA 780
CGGCTATTTT AATTTAGTAT TGTTGGTTTA ATTGTTACTA TCAAACCATT TTCAGTATAT 840