EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-19643 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:42939252-42939743 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr19:42939373-42939383TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr19:42939373-42939383TCTAATTAAA+6.02
ATF3MA0605.2chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT-6.11
ATF3MA0605.2chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT+6.14
ATF7MA0834.1chr19:42939717-42939731TGATGACGTCACTG-6.04
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT-6.02
Creb5MA0840.1chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT+6.37
HOXC11MA0651.1chr19:42939506-42939517GGTCGTAAAAC+6.14
HOXC12MA0906.1chr19:42939506-42939517GGTCGTAAAAC+6.14
HOXD10MA1506.1chr19:42939506-42939517GGTCGTAAAAC+6.62
HOXD12MA0873.1chr19:42939506-42939517GGTCGTAAAAC+6.02
Hoxa11MA0911.1chr19:42939506-42939518GGTCGTAAAACT+6.74
JDP2(var.2)MA0656.1chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT+6.07
JUNB(var.2)MA1140.2chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT+6.07
MIXL1MA0662.1chr19:42939694-42939704TCTAATTAAC+6.02
NFIL3MA0025.1chr19:42939673-42939684ACGTTACATAA-6.32
PHOX2AMA0713.1chr19:42939370-42939381TAATCTAATTA+6.32
POU1F1MA0784.1chr19:42939695-42939709CTAATTAACATATT-6.88
POU1F1MA0784.1chr19:42939580-42939594CTAATTTGCATATC-7.19
POU2F2MA0507.1chr19:42939580-42939593CTAATTTGCATAT+7.04
POU3F1MA0786.1chr19:42939581-42939593TAATTTGCATAT-6.74
POU3F2MA0787.1chr19:42939581-42939593TAATTTGCATAT-6.74
POU3F3MA0788.1chr19:42939581-42939594TAATTTGCATATC-6.09
POU3F3MA0788.1chr19:42939696-42939709TAATTAACATATT-6.36
POU5F1MA1115.1chr19:42939582-42939593AATTTGCATAT-6.62
PROP1MA0715.1chr19:42939370-42939381TAATCTAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr19:42939370-42939381TAATCTAATTA+6.32
Pou2f3MA0627.1chr19:42939579-42939595ACTAATTTGCATATCA-6.35
Enhancer Sequence
TTTGCAATTG GGCTTTTGCA TATCTGAAAT TATTTGTTGA AAGTATCAAT TCTGCATATT 60
ATATTAGTGA GTTTATAACT CACTTTCTGA TACATTAACT TAGCGTTCAT ATTTAGCTTA 120
ATCTAATTAA AAATATGTAT TTTTGAACAG GACATTTAAT AATCTGGGAG CGTTGACTTC 180
AAATGTATTA TTTGGCCATG TAACTTTCAT CCCCCTACTG GACGCATTAG GAACAACATG 240
GCCGTAAAAT TGTGGGTCGT AAAACTGCCT GGATCCAAGT CTGCAGACGC CCCATATATC 300
TAAAGCCTGC CCGAAAGGTT GCCACGCACT AATTTGCATA TCAGTGATCT TGTAATATCT 360
GACAAGCGTA AGCCCGTCAT GTCTTTACTC TTTAAGGTGC AGTGTATTAT AATATAGTAA 420
AACGTTACAT AAAGATATAG GTTCTAATTA ACATATTGCT TTGCCTGATG ACGTCACTGC 480
ATAATCACAG C 491