EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-19554 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:40528598-40529569 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr19:40529330-40529346TCTAATGTAAACAAAA+6.43
FOXB1MA0845.1chr19:40528619-40528630TATGTAAACAT+6.14
FOXC1MA0032.2chr19:40528619-40528630TATGTAAACAT+6.32
FOXC2MA0846.1chr19:40528619-40528631TATGTAAACATT+6.02
FOXC2MA0846.1chr19:40529333-40529345AATGTAAACAAA+6.37
FOXD2MA0847.2chr19:40529331-40529344CTAATGTAAACAA+6.11
FOXK2MA1103.1chr19:40529334-40529345ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr19:40529334-40529345ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr19:40529331-40529348CTAATGTAAACAAAAGC+6.76
IKZF1MA1508.1chr19:40528802-40528814ACTTCCTGTTCT-6.14
ZNF384MA1125.1chr19:40528652-40528664TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TTAAAACAAT TGACAGCAAT ATATGTAAAC ATTGCCAGCA TATATTGTTA TATCTTTAAA 60
AAAAAACAAA TAACTAAAAA ATAACCGTGA GGGAACACGT AAATTGATGT TTCGTAGAAA 120
TGTCTTGTGT GTTTTCGTTG ACAAGCCCTC TCGCATCTTT TGGTCTGCAG CTCTGCCGCC 180
ATGCTTAATT AGCCCCGCCT CTTCACTTCC TGTTCTGCGG CCGCGGTTCA AAAAGCTAGG 240
CTCTGAAACT GCTGGCCTGC AGATGGATAC TATCAAGTCA GCTAGGAGGA GCGTGTGCTT 300
GCCAAAATGG TCATTACCTG TGCTTGTCCT GGATGCGACA ATCGCTATAA AACATTAAGG 360
TTACGCTCGG ACTCAAAATT CCACCCTGGT AAATTAACAT TCCACAAATT TCCGACGTCT 420
GACCCTGAGC GGCTGAAGTT ATGGTTACTC GCACTTGGGC TGGATATCAA CACTCCATTA 480
AGTGTACTTG AGACGAGGAG AATCTGTAGT GATCACTTCT CCCCCTTTGA TTTTAAAGAC 540
ACCAAAGGAA GTATAGTTCA ACTGAAGTCA TGGGCTGTGC CGATGAATTT ATCGGAACAA 600
TTTGTGGTAA GTCAAATTTA CTCCAAAACT ATTTCTGTCA GTAACATGTT TCTTGTGTAT 660
TTAGGATATC CAAGCTTTCA CTTGTGTATT GAACAGTTAG CACTAGCAGT ATGCGCGCCT 720
TTCTGCTCGC AGTCTAATGT AAACAAAAGC ATGCGTCGCA GTGTTAATGT AACGTTACCA 780
CTGAATGTGT AGATCTCCCT ATTTATGTTG TGTAGATCAC GGGAAGTAAA GGTGCGAGCC 840
GCTAAATCAT ATAGGCAAAA TGTATTTATA TGGCGTATTT GTGCCTATTT TACACTATGA 900
AGAAACATTA AATTCCAAAC ACCACAGATA TGTGTTATTT AGCATATAAA GAATGACTTG 960
GCAAGCAAGC A 971