EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-19541 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:40160864-40162453 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr19:40162178-40162190AAAGTAAACAAA+6.62
FOXP2MA0593.1chr19:40162179-40162190AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr19:40162176-40162193AAAAAGTAAACAAATAA+7.28
Lhx3MA0135.1chr19:40161221-40161234ATTTAATTAATTT-6.07
TFAP2AMA0003.3chr19:40161531-40161542AGCCTGAGGCG-6.14
TFECMA0871.2chr19:40161715-40161726CCCACGTGACA+6.02
Enhancer Sequence
GACATCACGC TGCTGAGCCG ACATCGCGGT CCTCTGCCCC GCTCCGTTGC AGCAGCAACC 60
TGCTCACAAA AGAATCGTTT ATACTAATAC ATCTTAGTTT TAAAAGGGCA TATTGGAACA 120
AAAACAACCC ACATCCGCAC TGGCGTTTCA CCTAGCTTTT CTGTATAGCC TCCTTCCACA 180
GTATACCGCT GAAACCGCAC ATCACATGAC CACACACACT CTGTCATGCA CTGCTGTGTA 240
GGCTATGCGC GTGTCTGACT CTGTGCTTCA GTAGTCACCC TAGAGAGCAG TGCACGTTGA 300
ACAGTTTATT AAGGATTTAC CGCTGGATCG CGTCTCACTA AAGTTGTTAA AAGTGATATT 360
TAATTAATTT TGTCTCTATC TAACGACTCT CCAGTCTTTT GAATCTATCA GGTCACATGT 420
CAAAGCGTCA GTACACTTCT TCAATCTTTC GATTTCATGT GTGTACTTAG TAATTTTAGC 480
GAAAACCTCA GATACTGTTG GTTGGTTGCT GTTGGTTGTG CACCTTTTTT ACCCAACACA 540
TTCTCACTCC CAACTCGTCA CATACTGACG CTTGGTCAGG AACCCTCGGC GTAGGTTATT 600
GACGCACAGG GTACCCCTTT AGCGTCATAT TTAGACGTGC AGGGATTCCC TATAGAATAT 660
GTACCTGAGC CTGAGGCGTC ATAGGGAGAC GCTGGAGGCT CGTATAATTA CCAATAGATG 720
TCAACGCAAT TTTTAAAACC TGATTTACGC CTATTATCTT AGTTTTCTTA TTTTAAAAAT 780
ATGTAATTTT TATTTTGTTC ATGAAAAGCG TCTGTTAACG GGGTCGAAAC TACTGTATGA 840
ATAAACTTCG GCCCACGTGA CATCCCTTCA CGGTGAGTTT AACGCCGCTC TGCTATTGGT 900
CAAACTGCAT CAGCGGTGAG TTCTCAGATG AGTTCAACTG TCAACATTAA ATATTACGTT 960
AATGCTGCAT AATATATTTT TATTGGAGAT TAGTTGGTGT TTATAAATAT GTTATCATTT 1020
ACTTTATATT TAATGAGTGA AAATATATTC GGTTGTCCAG TTTAGGGTAA CTATGCCTAA 1080
TAAAACTTTG ATTCATTCAT ATTATTTATT ATTTACTTTA TTATTTTACT TTAAAAAAAT 1140
ATTAAATTTC AAGTACTAAG TTTAAAAATG TTTTCAGCTG ATATTTTTCA TTTTAAATTA 1200
TTTATTAAAG TTGGGGTCAT TGTATGTGGC GATCTATTTT TTACAGTCTA TGCTCGCTAT 1260
CCCAAGGTTC ATTGCGATCC CAAGGTTCAC TGCGGTTTTC CACAAGGTAA GTAAAAAGTA 1320
AACAAATAAA CACGATTTGT TGATAAAGCA TGTACTGTAA ACTAGCGACG TTATCTAATT 1380
ACATCAAGTT CATTTATTAA AAACATATTT TTCTCACATA TAACGTTGGT CATGCATTAG 1440
AACAATATAC ATTTTAAGAT AAGGAACAGT GTAACCAGAT TGTTGTTTTC CACAATAGAA 1500
TTCGTGCAAA ATCTATATAT AATATGCAAT ATGCAACTCT AATAATACAA ATGTATTCGT 1560
AATTGTTTCA ATATTAAAGA ACATCAAGT 1589