EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-19448 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:35877345-35877901 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr19:35877458-35877469TATGTAAACAT+6.14
FOXC1MA0032.2chr19:35877458-35877469TATGTAAACAT+6.32
NKX2-3MA0672.1chr19:35877807-35877817ACCACTTGAA+6.02
POU1F1MA0784.1chr19:35877539-35877553ATAATTAGCATATT-6.91
POU2F1MA0785.1chr19:35877541-35877553AATTAGCATATT-6.52
POU3F1MA0786.1chr19:35877540-35877552TAATTAGCATAT-6.44
POU3F2MA0787.1chr19:35877540-35877552TAATTAGCATAT-6.62
POU3F3MA0788.1chr19:35877540-35877553TAATTAGCATATT-7.04
Enhancer Sequence
CTGTGGTAAA TTGTAACTGT ATTCTGGGAA ATATGGGAAA TAAGTATTTT ATGGAGAAGG 60
GCACTTCTTT GGGATCATTT TTATACGTTT AGTTATTATT TTGTCATGTA GAGTATGTAA 120
ACATCTGATG TGAGATCGTT TATTCAGGGT ATTATGAAAA AAAAAACTTT ACTAGTCCTC 180
TTTTAACATG TAATATAATT AGCATATTTT CTGAAAAATC GTGCGATTAT CTAGAAAGCT 240
CAGACAGCAA AATTCAGAGA GGGTGCTCGC TGCAGAGCCA TTTGAGCAGA GCTGAGCTCC 300
AGCGAGGGGG AGCATGAGCT CTCGCTCTGC CTCCTGTAAG CTGTTTTAAT GCGTACACCA 360
ACCCCACCCC TAACCCTACC CCCAGTGACA TCACTCGTAG AAGAAGTGCA AAAAAGGTGG 420
AGCTCAAGCT CAAGAGCTCC CCCAAATGGC TCTGCAGCGA GCACCACTTG AAAATTCATG 480
AAAAATGCTC AATTAGAAAA CCTCTTTAAA TTGCAACTCT ATTAACAAAT AAATGCAGCA 540
TTAGTAATCA TTAGAG 556