EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-19157 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:28554692-28556798 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr19:28554926-28554936AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr19:28554926-28554936AACATATGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr19:28554925-28554937AAACATATGTTA-6.02
BHLHE23MA0817.1chr19:28554925-28554937AAACATATGTTA+6.92
ESX1MA0644.1chr19:28555479-28555489ACCAATTAAC+6.02
FOXK1MA0852.2chr19:28556621-28556635GATGTAAACAAGAT+6.34
FOXK2MA1103.1chr19:28556622-28556633ATGTAAACAAG+6.62
Foxo1MA0480.1chr19:28556623-28556634TGTAAACAAGA-6.02
Lhx3MA0135.1chr19:28556337-28556350GATTATTTAATTT-6.03
OLIG1MA0826.1chr19:28554926-28554936AACATATGTT+6.02
OLIG1MA0826.1chr19:28554926-28554936AACATATGTT-6.02
POU2F2MA0507.1chr19:28555960-28555973ACATGCAAATGCA-6.37
ZNF384MA1125.1chr19:28555182-28555194AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr19:28555183-28555195AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr19:28555184-28555196AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr19:28555181-28555193TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr19:28555180-28555192TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr19:28555179-28555191TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
ATCTTTTACT GGAAATGAGA CAGGCTTCTC TGAAAAGATA ATAAGACAAT GTACAAGAGG 60
AATCATTGTG GAAAAAAGAA TAATATTTCT CAGATTTTAT TAACATTTGA TCAAAATCTT 120
CAGTCAGAAT TTGCCACTGT AAATAAAAAC CTGGTTGCCT TAAATTTTTA AGCTGAATCA 180
AATTAACCGT ATGAGTCAGG ATTAACTTAG TTTAATAAGT TACAAAGAAC TAAAAACATA 240
TGTTATCATG ACTAATTAAT CATAATGTTT TATAGTGCAG ACATATGAAT GATATTAGGC 300
TTGAAAAAGT TTTCTACAAC TATTATTGGA ATTTTCCTTT TGGTGAACAC TATATTAATA 360
AAATTTGTTA AACAGGAGAA AATAAAAGAA ATAAAACACA AAATGGAAAT GAATTTTTTT 420
CTTCCCTCTT TTCTTTATAC TGTACAAGAT TCCCCCAACT AAAACATTTC ACAGTTAATT 480
TTCCTGCTTT AAAAAAAAAA AAAACGCAGT CTTCATTCAC GTTTAAGAAT GAACATATGC 540
TTGATTAAAA TCTTTCCAAG CCATGCTCCA CAACCTGAGG GTAAATGCTT CAGCTAATAC 600
CTCCTCATTA TCAATTAGCG GGTGGGTTAA AGTTTGTATG TAATCGGCTC TTAAGAGACT 660
CAATAGGTGT CATTAAACGT CCGAGATCCT CTGATAACGT GAACTCATCC CAAGAAAGGT 720
CATCCGCCCG TGGCCTGATA CAGTAGATCA TTGTCCAGAC CTGAGTCTGG TTCAGTTTCA 780
CCGGCTCACC AATTAACCAT TTCTAATCCG CGCTGTTTGC TGTTAAACTC AGCTCCATCA 840
TTTCCAACCG AGTTTCTGGA TTTAACAGAT GTTTTACACG ATTGCTGACC ACATCAGCGT 900
TGCCCTCCAC CCACTTTCAC CAGGGCAACA AAAACCTTTC AAACAGGCCC GTTTCACAAG 960
GCCTGCATTT GAATCCGTTT CACAGTTTAT TTATTCCTTT GTTTCAGCGC TAGTCAGTTT 1020
AATGCTTAGC ATGCACTATT AGCCATTAGC ATTGCTTTCA GGCTCACTAG GTTGCTGATC 1080
TTAGAAGCTT AAAACTCTCC CCGGTGCTTT GTTGTGGTCA CTGATGCTCA GAGGGGGTCC 1140
TGGGGGCCAA CACAATAGAT AAGGGGGCAG GAGAGCTTGT TGGCTTGGTG GTGGGATGGT 1200
TGGAAAAGGT ACCCTGAAGT GGAGGCTTGT TGATATGGCC CATTCAGCGA CATGCTTGGG 1260
ATAACCTTAC ATGCAAATGC ATCTGATAGC TGTGATGTCA TTGTTTTGGA GCAATTATCG 1320
TCATTGTTTC ATTAAAAAAG GTCATTTATA AATATTTAAA GGGTTAATTC ACCAATAAAT 1380
CAAGAATCCG TCATCATTTA GTCACCCTTA TTTTGCCTTT AATTGTGTAA AATGAGACAC 1440
ATTTACTTTT ATTTTATGAA GAAATAAAAC ACAGTGGTCT AATTTGTCAT TTGAGTTACA 1500
TTACACAAGT CATGTTTGGA TGAAATTTAG ATGAAGTTTG TGATATTATT GTAATTTTAA 1560
TTCTATTTTA TGCCACTGAT TACCAAACAA CATGCAGTAA TAGGTGTAAC AATTTTAAGG 1620
GACAAACCTA CCGTAACAAA CCTACGATTA TTTAATTTGA TGTTAGTGCT ATGTTAATGA 1680
CCTTATAAAA GCTTTGACAG TGGTGATGTA GGATGAAAAT GTACTTGTAA AATGTTTTTT 1740
ACTGTTATTT GTAATTTTGT GTCACTTTTC TGGAAGTAGA CGCAGCTTTG AAAGGCTTAT 1800
TTGGACAACT TCAAACCTTT AGTAGAAAAA CGTCAAATTA AATAACTAAA ATAAAACAAA 1860
AATCAGCTTT TAGTAAACAT TGTTACTAAT GGAGTGATAA GAAATCAGAT CAGATGACAG 1920
AGGCATTTGG ATGTAAACAA GATGGGTGAT ATATACTGTA TGATGCTGTC ACCAAAATTA 1980
TTAAGGGCAT GTTGATGCAT TGCTCTATAG GTCAATATAT TGATTATTAC AGCAGCCCTA 2040
CAAGTGCCTT TTACATTTTT GAAATAGAAA TCTGACTATG TAATCATGTT TGTTTTATTT 2100
TTGATG 2106