EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-18884 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:20255346-20256192 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr19:20256148-20256161CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr19:20256151-20256164TAATTAATTATTC+7.12
PBX2MA1113.1chr19:20255443-20255455GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr19:20255441-20255458AAGTGATTGACAGGTGG+6.14
POU1F1MA0784.1chr19:20255772-20255786AGTATGCAAATTAA+6.32
POU2F1MA0785.1chr19:20255772-20255784AGTATGCAAATT+6.14
POU3F2MA0787.1chr19:20255773-20255785GTATGCAAATTA+6.04
POU3F3MA0788.1chr19:20255772-20255785AGTATGCAAATTA+6.2
POU4F1MA0790.1chr19:20256152-20256166AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr19:20256150-20256166TTAATTAATTATTCAT-7.91
POU4F3MA0791.1chr19:20256150-20256166TTAATTAATTATTCAT-8
POU6F1MA0628.1chr19:20256149-20256159ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:20256149-20256159ATTAATTAAT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr19:20255771-20255787AAGTATGCAAATTAAG+6.42
SOX10MA0442.2chr19:20256089-20256100AAAACAAAGAC+6.14
Enhancer Sequence
AGCTACTGTC GGCTGGTTCC TGTTGGTTGT GCGTCTTTTT TACCGACGCC ATTATAAAGA 60
CACAGATCAC TGCCTATTCA CGAGTCCCGC AGAAAAAGTG ATTGACAGGT GGTAATTATG 120
TGTGTATCTT GCCTTTATTC ATTTACTGTA TTGTTGAAAA AAAATAAATG AATGAGTAAA 180
AAAGAGAGAA AAGAGAACCC AGTCCAGGAG ACTCGAAACA AGCAGAATTC CTTTATTGAG 240
ACGTGTTGGT TAATCTGCAG TCATACAGCG TCTTCAAGGT GTCCAATGTG TCTGCAAGAG 300
CCTACTAGAG GTCCGCAGTC TGCAAGTTCT TTTACAAGTC TCTCACAAGT CTCACACAAG 360
TCTGCATTAA GACAAAGATT TCATGTCTAT ATTGTGTTTT TAGGAGGAGG GGATTTGGCT 420
AAACAAAGTA TGCAAATTAA GAGTTGGAGT CAGCCTGGCA TGGGTGTTAA AAAACGGCCC 480
AGCTACTGAC CACACAAGTT AATCAACATA GGGTTTCTGT AGCATAAAAG CAACACCCGA 540
AGACAAAGAC AGAGTCGTTT AAAGCATTTG CATCACTGGC TTAGCCTGTG GTCAGAGAGA 600
TAAAGGTTAA ATGTCCCTCC TAGCTGGGAT GTTAATGAAA TTAAAAACCA AAGAATATAA 660
CTTTTTAGTT ATACGTAGAT TATTGTTCAT TTGGAATTAG TTGATAGAAA TTTATATTTC 720
CACAGTATGA TTTGTTTATG GGTAAAACAA AGACCATGCA GGTCAGGTAA TTTAAACGGT 780
AGGCTACAAA TAATTAATTG GTCATTAATT AATTATTCAT AATCGAAAAT CGAATCGAAT 840
CGTGCC 846