EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-18877 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:20188633-20189756 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr19:20189131-20189142TGCCATAAAAC+6.14
FOXC2MA0846.1chr19:20189596-20189608TTTGTTTACTTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr19:20189596-20189607TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr19:20189593-20189610GTTTTTGTTTACTTTTT-8.3
Hoxa11MA0911.1chr19:20189088-20189100GATCGTAAAATT+6.27
Enhancer Sequence
AGTTTTTACT TGCAATATTA AATCCTTTTG TAAGATTTGT TCCATTCAGC TGCGTTTTGT 60
GCTAGGCAAA GTTGTTTATA TGAACGTGAA ATGTACCACA CAACAGTTTA ATAATTATTA 120
ATGTGAGGTT AAGCATTGGT CATGTAAAAC TGAAATTAAA TAAATATTCC ACAATTCCGG 180
TGCTTTAGAT TAATTCGATC ATTTCTTTAA AACTTTGAGT TGTTCAACAT TGTTGAATCA 240
ACAGGTATAT GACGCGCCAA TTTCTTAGGT CCCCTTGCCA ACTTGTCAAT GAGAGTGTGC 300
ATCCACGCCC AGTGTCCAGC ACTCTTCTCA TTCATTAATT TTCCTCCTTC TTTGGAAATC 360
ACGGTTTTGA GGGAAAACTT TACTAGACCC TTTACCATTC TGGATCCACG ACATTGGCTG 420
GTAAGATAAA TAATGAGTGT TTGGTCCACG AATTAGATCG TAAAATTCAC TCGGACTGAG 480
ACTGCAGATA GGCTCACTTG CCATAAAACA GTCACGTGGT GGCAATTAAA GTCAGTTTTA 540
TGGTTTTGGG GAGTCGACAC TATATGGCAT ATAAAGTTAA ATCGCACTGA CGTGGAGCTT 600
CGTTTTCTTT CTCTGTAGAC CGTAGAGGTG TTTCTTGACT GCACCAGCAA CTGCTTCTAA 660
CAAGCCAGAT TGCTATGGAC TGGAAACGCA CCGACCGGAT TTACTCGGGC GACCGAGGGC 720
CAGCTCTTGG TAAGTTCAAG TTGGTTTATT TCGGTTTTAC GCTTCTGTAA CAAAGTTTTC 780
TTTAGGCTCT CGGTAAAACA ATGAGCAGAA CAGAAATGCA CTCAGTTCCT AATGCGCTAA 840
CTGAGGGGGT TGCATTGTGA ATACCTTGCC GGGCAGATGG GGATTGCTCT TTGATTATCT 900
GATTTCGTCC TAATACAATA TTTTTGCTCC TTGCTCTGCA TAAAGTAATG ACTTGTATGA 960
GTTTTTGTTT ACTTTTTAGT GGTATCACCA TATGATATCG TATAGTATTT TATACAAGGA 1020
GTTGGGTCAA GTGTACATGA TAATAATACA CTGGATTAAA CTGACCTTAA ATCCATTGTT 1080
TAAAAATGTT TTGTTGTATA AAGTCAACAT TTGTATAAAG TTT 1123