EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-18507 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:11235522-11237632 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA6MA1104.1chr19:11236884-11236897TTTCTTATCTCCT-6.59
Gata4MA0482.1chr19:11236886-11236897TCTTATCTCCT+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:11236545-11236560AAGGTCAAAAGATCA+7.24
ONECUT3MA0757.1chr19:11236614-11236628CAGAAATCAATAAT+6.03
ONECUT3MA0757.1chr19:11236969-11236983CATAAATCAATAAA+6.17
RARAMA0729.1chr19:11236545-11236563AAGGTCAAAAGATCAAAT+6.68
RarbMA0857.1chr19:11236544-11236560AAAGGTCAAAAGATCA+7.67
Rarg(var.2)MA0860.1chr19:11236535-11236552AGGGCCAAGAAAGGTCA+6.56
RargMA0859.1chr19:11236545-11236561AAGGTCAAAAGATCAA+7.06
Stat6MA0520.1chr19:11236642-11236657GCGTTCCTGAGAAAT+6.39
ZNF24MA1124.1chr19:11237304-11237317CATCCATTCATTC+6.44
ZNF24MA1124.1chr19:11237308-11237321CATTCATTCATTT+7.34
ZNF263MA0528.1chr19:11237159-11237180CCCCCTTCCCTCCCCTCCCCA-6.85
ZNF384MA1125.1chr19:11236003-11236015TTTTTTTTTACA-6.07
ZNF384MA1125.1chr19:11235999-11236011TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:11236000-11236012TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:11236001-11236013TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
AAAATTTAAA AAATGTAACA CGGGCTAATA ATTTTGCTGT CAACTACATT ACATAATATT 60
GTTATTACAT TGGTTATTAT TACACATAAT TTACATGATC CACCTCCGTC ATGTGAGCTT 120
GTGGCACAGA ATAATAATAA TGGCAGAGCA GCACGAGACT GAACTGTGCA GGTTAGATGT 180
ACAACACTTG CACAGTCAGT CTTCTCAGTT AGAGCCTCCT ATTCAGTCAA GGAAAATTAC 240
AAATTATTCA ACATTTTAAA TGGAAGTTAA AGAAATGGCT AAAAGTGAAT CAAGTTTGCA 300
CTCATGTAAT TTTTCTCTCT TGTTTTTTAA AACATTTTTA TCAAATTTTT TAAAAACTTT 360
TTTGTAAGTC ATTTTATTGC TATTGTATGT ATAATAATGG GTTTTTGATG CTGGACTGCG 420
ATTTTTAAAT CTGGCAGAGG GCAACAGTTG AAAATTAGCC ATTAGGCCTA ACTCTGATTT 480
TTTTTTTTTT ACAGTTTTAC TTGATTAATG AGCATCGTCC CTGTTAAATA AAATAAAATA 540
CCTAAAATAA AATAGAATAA GTGTACAGCC TATGACAACT TCTGCTTCTA AGATCTTCTG 600
AAAAGGGTCC ACAGAGAGTG AAATTCTTCA AAAATATCAG ATAATTCATT TTATTGTCCT 660
TTTTTTCCAG CAAGATGTGT CCTATCGCCA CCTTATTTGC TGCTGTCAGT AACCAAATGA 720
CCATAAACAT GCCCTCCACC CCCTTTCCTT CCTCACCCCC GACTCTATTT ATCTCCTCTT 780
CCTTTTCTTA TTCGCTGTGA AGGAGGCCGC ATGCAGTCTC AGAGGGGGTT CTGAGTAATA 840
CTTACTGAAT GCTAACTAAT GACTAGATCT GTGTTAGTCA AAGTTGAGAG GTTTCTTGTT 900
ACAGTGAACT TTGATCAGCC TAAGATAAAC TGATAAAAAG AACTTCCGGT TCTCAAATAT 960
ACAGCACACA GCACATCATG TTTAAATAAT CTCAGGAATC ACTGTCAAGT CTTAGGGCCA 1020
AGAAAGGTCA AAAGATCAAA TGCAAGGACA CTTTTATCAA GGGAATGAAG TCACTTTAAA 1080
AAGGTCTATC AACAGAAATC AATAATCACA ATCAGATCGA GCGTTCCTGA GAAATTAGCC 1140
AAATGAAACT GCAACTTTAA ATCAGTTCCA GAAAAGCATT CCCGTCATAT GCGTAGCATG 1200
AAGGAATGAG AGATACCTTG TTTATGACAT GCTGACTTCT ACGGTACTCA ACCCCCTCGA 1260
CACACACACG CAATGACGCT GTTGACAACA ACTGCTGTGT TTACACACTT GAGATTCAGG 1320
CCACACACAT TAATGAGTTG ACTCTTGTTA AAAGTTTTCC CATTTCTTAT CTCCTTATAT 1380
GTCATTTGTT TGCTATTTAG ACTTTAAAAA GTACTGGGTC CCACAGAAAT TCTTCATGTT 1440
GTTCCAACAT AAATCAATAA AATTTACTTA ACCATTTTTA CAAAATTTAA GTGGATTGTA 1500
AATAAAACCA TTATGTTGTC CGCCCCTAAA AAAACTTTGA ATTGTGTTGT TTTAACTCAT 1560
TTTAAATAGT TAAAAATTTA TTTTCTTCAG TAATTTAAAA GTACCATAAG TTTATTTTAA 1620
CATCTGTTTT AACACCCCCC CCTTCCCTCC CCTCCCCAAC TGCGGCAGTT AGAACAGACT 1680
TTAAATAGAT GTTACTCTTA TAAATCCAGT AAATACAGAT AAATAATATA AACTCAATAA 1740
TTAAAAAAGC ACACATAAAG AAAATAATAA CAAACAAAAT AACATCCATT CATTCATTTC 1800
TTTTTCAGCT TATCCGGAGC ACCCGGAGGA AACCCACGCG AACGCAGGGA GAACATGCAA 1860
ACTCCTCACA GAAACACCAT CTGAGCCAAG GTTCGAACCA GCAACCCAGC GACCTTCTTG 1920
CTCTGAGGCA ACAGCACTAC CTACTGCGCC ACTGCGTCAC CAGTTCACAC TCATACACTG 1980
TGGACAATTT AGCTTAACCA ATTCACCTGA ACTGCATGTC TTAGGACATG TGGGGGAAAC 2040
CGGAGAACCC GGAGGAAACC CACTCACATG CAGGGAGAAC ATGCAAACTC TACGCAGAAA 2100
TGTCAACTGA 2110