EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-18390 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:7544651-7545519 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr19:7544764-7544781ATTAATTAATTAATTGG-6.83
Alx4MA0853.1chr19:7544764-7544781ATTAATTAATTAATTGG-6.29
Lhx3MA0135.1chr19:7544762-7544775TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:7544766-7544779TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:7544763-7544776AATTAATTAATTA-6.78
Nkx3-2MA0122.3chr19:7544895-7544908AAAAACACTTAAA+6.64
POU3F1MA0786.1chr19:7545094-7545106TTATGCTAATTT+6.37
POU3F2MA0787.1chr19:7545094-7545106TTATGCTAATTT+6.22
POU3F3MA0788.1chr19:7545093-7545106CTTATGCTAATTT+6.05
POU6F1MA0628.1chr19:7544764-7544774ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:7544768-7544778ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:7544764-7544774ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:7544768-7544778ATTAATTAAT-6.02
ZNF143MA0088.2chr19:7544908-7544924CTGCCATAATGCACTG+6.02
ZNF282MA1154.1chr19:7545490-7545507TTTTCCCACAACAGTAA+6
Enhancer Sequence
CTTACAAATT AGCTGTAAAA AAGGGGAAAA TAAGTGAATG ATGATAAACG ATGAGGACAT 60
TTTAATTTTT GGGTGAACTA TCTTTTAGAT TAGGCTGCAC ATAATGTAAT GTAATTAATT 120
AATTAATTGG CCTTTTATTA CATGCCAACC CTGATAGTCT TTTTTATATT TGTATAAAGT 180
AAATCATTAA ATCCTGTCCT CCAGCAAGAA AAATAGTTCA GCTTTTTAAA AAAATGAATG 240
GAGGAAAAAC ACTTAAACTG CCATAATGCA CTGCAATGGA CGTCAATTTA CAGGAATTTG 300
TTCTATTATT TAGTGGGTCT TGCCCATTTG GTGCTTGACA TGGCTGTGAT AGTTGCTGGA 360
GAAGCACAGA GAAATAATTT ACACCGTCAT AGGAAACACA CACAGAACTC TACACTCCCA 420
CTTGCATTTT ATGGATTGCT CTCTTATGCT AATTTGCCCA ATTAGGGAAT CTAGTGCTTG 480
CTCTTTAACC ACAACTCCTC GGTTCAGCTG TGGGTGCAGG GTTGCTTTTG CACAAGAGAT 540
ACTAAAACAG TTTGAACATG TTTGCACTTT TAAGTCACAT GTTAAGACTA AAAAGTTTTC 600
CATTCCTGTT TTAAACATTT CTATTGACCC GATGTCAGTA CAAAATGTAA AATATAATAC 660
TAATATTTAT ACACCTCTTA AACTCTCAAA TATTTGGACA ATTTAAAAGG ACAGTTCACC 720
TAAAAATTCA AAGTGTCATC ATTTACCTGC CATTCAATTG ACTCACTCTT GTTAAACACA 780
AAAGAAGATA TTTTGAAAAA GGTTGGAATC TAATAGCCAT TAACTTCCAT AGTATTTGTT 840
TTTCCCACAA CAGTAAAGAA TAAAGGTT 868