EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-18123 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:859470-860684 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr19:860316-860327GAGCCATAAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr19:860611-860628TCAAAATAAACAAACAA+6.09
TCF7L2MA0523.1chr19:860565-860579ACACTTCAAAGGAA+6.1
Enhancer Sequence
CGTGTATGCA AAACCACCCG TGGACGCGCG TCCCGCCAGA TGCTCGTCAC CGCGGCAGCA 60
GCTCGTGCAC GCTGATCCGG TCTGGGATTC GCTGACACGG GTGATGAAGG AGCACGGAAC 120
ATTTTTAGCC CCGCTACCCC CATCAGAAGC CCGCCCGGGG CAGATGATCT CAGCGCCATC 180
AGGAGCTCAG CATCATTAGA AGGTGTTAAT TGGAGTTAGT CGGAGTCTTC GCTTTCTGTC 240
AAGAAGTCTG ACAACAGAAT TCATTAGACT TAAAAATACC GGGGCACTGA AATGAATTCA 300
AGAGGGAATC GCTGATGAGG AAGGATTGTT AGCTGACAGA CAGAACAGAG CTCAGAAAGG 360
GTCCAATTCT CATTAAAGAT GCCAAATATG GGCCCCGTGC GCGTGCATCA GGCGCGGGAA 420
GTTTTTCAGC ACGACCAGCA TCTCATATTT GATGCGTAAT ATTCACACTT TCATTGAGCT 480
CCTTCTCACA AAAAAATAAA TACATAAAAA TGCAGCAGGA AGGAAGATCA CATGCATCCT 540
CAATTAGGAA AATTGCATGT GTCAAAAAAG GAGGAAAAGA AATAAACTAT GTTATATTTA 600
AATGGTTGAT GTTTTATACG CACACACAGC CTTTTTAAAA TAAAGTTGCT TTAAAACAAC 660
CTGTGTATTT TCTTACAAGT TCTGTGTAGT TAAAAAGATA CTGAGACTTC TGCTATCTGC 720
TGAGAATAAT ATAAATGTGT TTAATGCGCT TCTGCGGTCG CTCTGCTGAA AGTGCTCTGG 780
TGTGTTTGGG TTAAAAAGGA AAATACAAGT TATTTGTGCT ACTTTCATCG AAAGCACAGA 840
AAATAGGAGC CATAAAATGG GGAGATAGCA AATGAGGAAC TGCAGAGACT TCCTCTGTCA 900
CACACACACA CGCACACCCA GAAATGCGCT TTGTGTGATC CGAAATAACT CCGGGAAAAA 960
GCAGTTGAAT AAACGGGCGA CACACTCCTG CCAGACAGAA AACGATGAAA CACGAAATAA 1020
GAAGCAACGG CGCGCTTGTG GTCGTTTAAA ATAAGAACGA TTCGAATTCT CGGAATGTTT 1080
AGAAGGCTCG GCGCAACACT TCAAAGGAAC GAATGCTGTC GGTTAGGATT TAAAATATTC 1140
GTCAAAATAA ACAAACAATA TAGCGATATT ATTATATAGC AATAATAAAT AAATAAAAAA 1200
ACAGGCGACT CAAT 1214