EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-18082 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr19:98743-99664 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF13MA0657.1chr19:99532-99550AAGACACGCCCCCATGTG+6.79
KLF16MA0741.1chr19:99534-99545GACACGCCCCC+6.32
NFYBMA0502.1chr19:99010-99025CTGATTGGTCAATAG-6.2
NR4A1MA1112.2chr19:99342-99352GTGACCTTTA-6.02
PBX2MA1113.1chr19:99573-99585GTGATTGACAGG+7.22
POU1F1MA0784.1chr19:99268-99282CTCATTTGCATATG-6.71
POU2F2MA0507.1chr19:99268-99281CTCATTTGCATAT+7.52
POU3F1MA0786.1chr19:99269-99281TCATTTGCATAT-6.18
POU3F2MA0787.1chr19:99269-99281TCATTTGCATAT-6.37
POU5F1MA1115.1chr19:99270-99281CATTTGCATAT-6.32
Pou2f3MA0627.1chr19:99267-99283GCTCATTTGCATATGA-6.7
SP4MA0685.1chr19:99531-99548CAAGACACGCCCCCATG+6.31
Enhancer Sequence
GTGTATCAAT GTGTGTGTGC ATGCATATCT CTGTGTGTGT CAATGTGTGA CTGTGTATCT 60
CTCACAGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 120
TTGGCACAGG TCTGAGAGCA GGTGGTTGAG CTCCGTGTAC AGCGAGAGAC AGACTCCACA 180
CTGAAACACT CAGATATAAG ATCAGTGGAG TGTCACACTA GACCAATAAC TGATGTGTGT 240
TTGTGTGTGT GTGTGTGTTT CTGGATGCTG ATTGGTCAAT AGTGCAGTAC AGCACCGCCT 300
GCTCAGGGTG AAGTATTAAA CTGAAGAGCT TCAGCAGAGA TCTACAGCCG GGTCAACACC 360
CAAACTCCAT CAGACGAGGA CCATCTGCCT CTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTCAT 420
AAGTGTGAAT GTGTGTGTGT GGGATGGTGA AAGAACTATG CAAAGGTTTC GAATGTCCTG 480
TGAATATTCA TGAGGTCATA AGTGATGTGT GTCAGTAGGC GGAGGCTCAT TTGCATATGA 540
TTAGCGGTTG TCAGGGAGGT GTTGATGTGA CACAGTGTAC TGAGGGCAGA CGAGAGAGTG 600
TGACCTTTAG AGCTGCGATA CACACACACA CATACACACA TGCACACTCA ACACACACAC 660
ACAAACAACA CACAACGCAC AAAACACACA CCCACCTCTC GCTCTCGTCC CAGGCGATGC 720
AGGTCTCGTT GACGGTGCCC TGCAGAGACA GACACACACA GTCTGGTCAG TGGGTGTGGA 780
TAAGATCACA AGACACGCCC CCATGTGAGT GATTGACATG TGACTGAGGT GTGATTGACA 840
GGACAGAGAC TCACGTTGTG CAGGTGAGGA AACTCGATCT CCACCGGAGC GGAGAGGAAC 900
CCTGGGTTAG GCTTCACCGT C 921