EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-18000 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:49323189-49324177 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr18:49323362-49323373TTAATTAAATT-6.32
SP1MA0079.4chr18:49324084-49324099TTAACCCCGCCCACC+6.44
SP2MA0516.2chr18:49324083-49324100TTTAACCCCGCCCACCT+6.24
SP4MA0685.1chr18:49324084-49324101TTAACCCCGCCCACCTT+6.49
Enhancer Sequence
CACAGTTCAA TAAACATGTA CAGACATCAC CTATACACTA TAATATCGCA GGTTAACTAT 60
GTTTAAATAT AGTAACTTAT ATTTGATTGT AACTTTAACT TAATTTGATT GTGTTGATGT 120
AATGTGCAGC TTTTGGAAAG CTGCCTTTAA ACAATAATTA GTGTAAAAAG TACTTAATTA 180
AATTGAGTTA AATTGAAGAA CAGTTTAAAA AGCAAAGTGT GTTCAGATTT AGGAAACTAA 240
AGCAACAGAT TTGTAATACA AACTGTGTAT TTAAGTGCAC TGTGCCTTTA AATGAATCAT 300
CTGAATCTTG AAGTTATTTT GGAATGATTC AAAGACTTTG AGAACAACAC ACACACTTAA 360
ACATGTACAT ATGCATCACA TATACGCTAT AAGATTGCAG GGTAACTATG TTTAAGTAAC 420
TTATATTTGA TTGTAACTCT ATATTTGATT GTAATGCAAT GATGTGCTCC TTTTGGAAAG 480
CTGCTTTGAA GCAATAATTG TTATAAAAAG TGCTTAATAC ACTTGAGCTG AATTGAAGAA 540
CAGTTTAGAA AGCAAAGTGT GTACAGATTT AAGGAACTAA AGCGTCAGGT TTGTGTTGTA 600
AACTCTCTGT TTAAGTGCAC TGTGCCTTTA AATGATTCAT TCGAACCTTA AAGTTCCAAA 660
AGAGTAGCTA ATAAAGCAAA GTTTGCATTC TTACCTTGCA AAATTCATCA TCCAACTCCA 720
GGAAGGGTGT GAGGAAATTT GATGGCATTT TTCAGGATGC CTGGCTGTGG TGTTTCTCTT 780
TTTCTATATA TTATTATGTC AGTGTGCAGT TGAGGTTTTG TTGAACTGCT CAACTACTGA 840
TGCTCTGCTT CTGCTGCAGC CCATCTGTTG GAATCTCCTT TATAAGTGGA AACTTTTAAC 900
CCCGCCCACC TTTTGAAGAG GCGTGTTTTA GTGCTTTGTT CACACCCCTT CAAAAGTGAG 960
GAAAGTTTGC TTGTGAAGGA TTTCTCTC 988