EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-17817 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:44488626-44489521 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxo1MA0480.1chr18:44489315-44489326TGCTGTTTACA+6.14
NR2C2MA0504.1chr18:44489353-44489368AGAGGTCAGAGGTCA+8.73
NR2F1MA0017.2chr18:44489359-44489372CAGAGGTCAAAGG+6.74
Nr2f6MA0677.1chr18:44489361-44489375GAGGTCAAAGGACA+6.14
Nr2f6MA0677.1chr18:44489354-44489368GAGGTCAGAGGTCA+7.42
RARA(var.2)MA0730.1chr18:44489344-44489361GGGACATTCAGAGGTCA+6.17
RXRBMA0855.1chr18:44489361-44489375GAGGTCAAAGGACA+6.2
RXRBMA0855.1chr18:44489354-44489368GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRGMA0856.1chr18:44489354-44489368GAGGTCAGAGGTCA+6.91
RxraMA0512.2chr18:44489361-44489375GAGGTCAAAGGACA+6.19
RxraMA0512.2chr18:44489354-44489368GAGGTCAGAGGTCA+6.88
Enhancer Sequence
AGCTAAACTG TGCAGGACAT CAGCCCTCCA GGCCTGAGCT AGGGTGTGAG AGACATTAAA 60
ACCTCTCGCT TCCTGACCAC TGGCTGAGCG AAAGTCATGC AAATGCTATG AGCAGGGTCT 120
CAACGACTGT GCTCATGTCT TCGTTGATCC ATTCTGGCCA AAGAAACTCT TTTGTTAATA 180
AAACTTGTGT GGTCAGTGAC TGGGGAGGTT CTTTCACCCA TCTACTTCAT TCGCATGCTT 240
TGTTAACCAT CTCCACCTTG GGCCATTGCC CCATCTTAAA TACAATGTAA TAGACAGAAC 300
AGCCTTGTCC ATGCTAGACT CATTTTAAAC TAGCTTAAGA CTCGAGACTT GCTAGGCTTG 360
TGTTAAAGTC ACGTTGACTT CTTGTGAAGA TGCTGTTTGA CTACAGAACA ACCAATATAT 420
CTCAATAGCG AATTCTGCTT GTCGAGTCTC CTGGTTTGGG CTCTCATTTT TCCAACTCTG 480
CCTAAGATTT AAAGTTGAAG ATCACTTGAT TGCAGACATT TTATAACTTT ATAATCAATC 540
TATAATCATA AATAATAATC CAAAAGCATA AACAGGAATT CACTGTGATA AATAAGCTAA 600
CAAATTTGCT TTAAAACTAC TCAACATCAT TCTCCCTGTA ACAGATTTGC ACAATGTGTC 660
CTGCCAAGGC GTCAAATGCC ACCATTCTCT GCTGTTTACA GACACAGTTC GAGTGTGAGG 720
GACATTCAGA GGTCAGAGGT CAAAGGACAG CTCTCCGCCA GTGTCTCTAG GTCACGCTCT 780
TCCCAGCATG CTCAGCAAGC CAGCTTTTAC GAGTCCGCCA AAGAGGAGAC GGCAGAGGTC 840
AGAGTAGAGC ATAGGAGAGG AAAAGTGTGT GTTTGCTTTG CCCAGACCTC AGAAA 895