EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-17641 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:39197432-39198832 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr18:39198659-39198676GTAAATTAATTAGCTCT-6.05
Arid5aMA0602.1chr18:39198616-39198630CTAATATTTATAGA+6.08
CTCFMA0139.1chr18:39198474-39198493ATGCCAGTAGGTGGCGACA+6.31
Lhx3MA0135.1chr18:39198661-39198674AAATTAATTAGCT+6.15
RUNX3MA0684.1chr18:39198138-39198148AAACCGCAAA+6.02
Rarg(var.2)MA0860.1chr18:39197887-39197904AAGGTCATGGGAGGGCA+6.47
Enhancer Sequence
TGATGACAAC ACAAAGTCAG AGTAATACAA ATGTCTGCGT AAATGCTTCT AGAGAAAGTC 60
AACGAGGCCA GTCATTACAT TTTAGGCAAC TGATTTGCAT GTTAAATAAA TCCACCCTCG 120
CTGGTGGCGT GAGGTAGCAG ATGACTCATG CAGACTGTGA GATGGCCTTG AAACCAAACA 180
GCATGAAGTT TAAATGTCAG ACAAAACTGA CAGACTCAGT CACACATCAT ACTTGCTGTC 240
AATTGCCAAG GCAAGCATTA CTATTGCTCA TGATTACAGG ACTTCACTCA TCTTGAACCA 300
TTTGCAAAAT GGACGTCAAT TACACTTAAA ATTACACAAC TTGGGTAAAA GCAAATAAAT 360
CAATACATAT CTATAAACCA TGTGAATGAA ACTCACATCT CTATTTATAT GACAAAGTAG 420
CTCATTCGGT TAAAAAAATA TTCAAACTCA GTTACAAGGT CATGGGAGGG CACAAAAGTG 480
GGTCAAATTC AAAATGTAGT GAAGAAGTCA GTTTAGACTA GTTTGAGTCA ATGTGAAAAA 540
TAGAGCTGAA GGGAGGAAAA TAACACCCAC AGTCCAACTT TTGCCTCTAT ATACCAGAAA 600
CACAGGCTCA TCTCACACCA CATTTAAAGT GCATGCGCAC TATGAACACA AGAGCTGATC 660
AACAGTGTTG GAGGGGAAAG CCTCTGGTAG GTGACCAAAA ACTCTAAAAC CGCAAAAAGC 720
TGCAGAGACG ATGCAGAACA AGTCTGAACC CAATGACACA GACAAACATC AAAAGCAGAA 780
GTTGGAGAAA GACCAGAATC CAAAGCACTC AGCCAAACAC AGACAAAGAG AAGAGAGGGG 840
GAAGGGAAGA GTGAAGCGAA GTGGGGGTTG ATCCGCTCTG CACGTGAGTT CCAAACATTC 900
CTCAGACGGG GTCGTATTTC TAGGGCAGAG CAGCAAAACT CAAGATAATA TTAGCAGAAC 960
CACGAGAGCA TAAGTCACGA ATCACCTAAT AATGAAAATG GAGTCATCAT CATCATCATA 1020
GAACTGTTGA AGTGTTGTTC TAATGCCAGT AGGTGGCGAC AAGTTTTAAT AAGTGCATAA 1080
TTTATCCTCG GAGCTGGTCA TCTTCCAAAA ACAAAATTCA TGCTTTTTTG GGGACTACTT 1140
TTGTAAAATA AAAAAAATAA AAATGATACA ACTATATATC TTGGCTAATA TTTATAGAGT 1200
AGTAATAGCA ATATACTTAA TTGTTGCGTA AATTAATTAG CTCTCAAATG TGCAATCATA 1260
AGTCAAAAAC AAGTAAATTA CAATTACTCT GATAATCAAT TAGTTGAATA CTTTTTTGTT 1320
CGAGTTATTT GACGTTACGT TTTGCTTATT AAAACTATAT AAAACATAAA TCTGGGTATT 1380
ATTTATGATT AATAAGTATA 1400