EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-17457 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:34018953-34019845 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr18:34019712-34019722TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr18:34019712-34019722TTTAATTAGA-6.02
Alx1MA0854.1chr18:34019341-34019358TGATTTAATTAATCAGT+6.36
CTCFMA0139.1chr18:34019173-34019192TGGCCACCAGGGGGCCCCC+6.93
CTCFMA0139.1chr18:34019404-34019423CCGCCACCAGGTGGCGCTT+7.24
CTCFLMA1102.1chr18:34019177-34019191CACCAGGGGGCCCC+6.43
FOXA1MA0148.4chr18:34019455-34019471CGTTATGTAAACAAAC+8.27
FOXC2MA0846.1chr18:34019458-34019470TATGTAAACAAA+6.74
FOXD2MA0847.2chr18:34019456-34019469GTTATGTAAACAA+7.04
FOXK2MA1103.1chr18:34019459-34019470ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr18:34019459-34019470ATGTAAACAAA+6.14
IRF7MA0772.1chr18:34019216-34019230ACTTTCGTTTTAGT-6.18
LMX1BMA0703.2chr18:34019342-34019353GATTTAATTAA+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr18:34019043-34019056ATTAAGTGGTTGT-6.32
Enhancer Sequence
GCGCTCTTTA TGCTTGTCTC ATAATCTATT TTTCTTTAGT TTTTTTATTG GTTATGTAAT 60
TGCTTATAAA GTGACTGCTG TTCACACACA ATTAAGTGGT TGTTTGTTAC GCCTGTTTCA 120
CACCGCAAGC ATGAGCAGAG CATGAGCAGT GCGTGCACAG CATGTATGGG GCAGAGCCGG 180
CCCAAGGCAT AAGCGAACTA AGCGGCTGCT TAGGGCCCCG TGGCCACCAG GGGGCCCCCA 240
AGAGTGCTTA AAATTATTGT GTGACTTTCG TTTTAGTTTG TCAAGTTGTG GATTAGTGGT 300
GGGACAAATT ATATGCCCAT TTATAGTGTT ATTTATGACG CGATACATAC TCAGGCGCCA 360
AGATATTTAC CTAAATTTAC AAAAGATCTG ATTTAATTAA TCAGTTTTCA ACCCCGACAG 420
CAGATAACCG CATTAGCTAC AGTACACCCA GCCGCCACCA GGTGGCGCTT CCCGTAATGG 480
CGGATCATCG GACATACCCC AGCGTTATGT AAACAAACTG AAAGACAGAT GATTGCAATG 540
GTGAATATCT CAGGCATACA GACACTTTCT TCTGTCCAAG CTGGGCCAAT GTATTTGTGT 600
GTTTCAGACA TCCAGCTCCC CCGAATTTGC CACTAGTTTC TTTCTAACAG ACGCGCTTTC 660
ACTTCGCTAT ATCGCTCGCG CGTGCCCGCG GCCAGTGCAA CTTCCTATGT GCTCAAACTT 720
TTTAACTCCG CCAAAATATA TATCAATAGG ACATGAACAT TTAATTAGAA AGGCCTTGCG 780
TTTATTTGAC TCTTACAGAC CTTGTCAAAG TCTTGTAGAT GGTATTTTGG CAAAAAAAAA 840
TGTTAGGGGA ATTAAAAAAC TTAAATAGAT GAGTAAATTA CTAATGTTCT CC 892