EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-17279 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:27924722-27925818 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr18:27924810-27924824TAAAGGTAAACAAG+6.96
GBX1MA0889.1chr18:27925236-27925246GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr18:27925236-27925246GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr18:27925236-27925246GCTAATTAGT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr18:27925399-27925412TGAACCACTTAAA+6.33
POU1F1MA0784.1chr18:27925231-27925245TTTATGCTAATTAG+6.98
POU3F1MA0786.1chr18:27925232-27925244TTATGCTAATTA+6.92
POU3F2MA0787.1chr18:27925232-27925244TTATGCTAATTA+6.92
POU3F3MA0788.1chr18:27925231-27925244TTTATGCTAATTA+6.82
Enhancer Sequence
CGTTTATGCA TTACAGTCGT GTGATCACCA CAAACATATA TGATTAACAA AAAGACACAC 60
CAATAAAAAA AACTCAGCCA TTATAGGTTA AAGGTAAACA AGTTATTTTA ATCTTTAATC 120
GAGTGGTTGG GTTTGTTCAT ATTTTACCCA AATATGAGTT GAAAGTATTT TTATACTTTT 180
CAGATGTTCA AGTATAAACA TTACAGCTGT AAAAGCTAAA CAGTTCTTTC AACACTTACT 240
GTATGTCATT GTAGCACTTT TCCACTGAGT AATTTAGAAA CCACCTCCCC TACCGCCTGA 300
CATCCTCTTA CCAGAGACAA TGCAGAAGGG ACTAAAAACC CCAGCTGGTC AAACAGAGCT 360
GACCAAATTG CTTGAGCGGT GTTTCTTATG CGCATCCACA AACAAGTAGC ATTCAACTAA 420
ACAAACTGAA GTACCTCATT GTTAAAGGTT GCCGCTGTTC TGTCTCTTTT CAGCTGCTTT 480
AAACTTACAA AAAATGTGTC AACGACAGGT TTATGCTAAT TAGTATCTTT AGTGAATGCA 540
GTAAAACAGT ATCCAGTGTA ATCCAGCTTA CTGTAGGTCA GTAACAATCA GATAAACAGC 600
ATCTCTTCTG TGGGCGGCTG ACATTTGGAG ATGACAAAAC ACAAGCACTC AGGCAGACAA 660
CTGAGGTTAA TTCAGCATGA ACCACTTAAA CACAGGTTAC GGTGATTTTT AAAGATTATC 720
ATTTTAAAAT CTTCATGATT CAACATGTAC TATATTGTAT TGACCACCAC TGCTTTTTTA 780
TGTCATGTAC TAATTTACAT TTTTTATTTA TTATCTGTGT TTAGCCTACA CACATGCACA 840
TCACATTTTC ATGCTTCAAG GGAGGTTCTT ATAAACATAA TCACATTTAT ATCGTAAGGA 900
CTGTATTTTG TGTGCTATTC CCAACCCTTT CCATAAACCC AACCCTCACA GAAAACATTC 960
TGCACTTTTA CATTTATCAA AATGGTTCAT TCTGGATTAT TTACGAGCCT CTTTCCTCAT 1020
GGTTGGCCAA AAAAAATCCC CACAAGCCTA CATAATCCTA CATTATAACT ATACTTGTGG 1080
ACATTTTGTA TGAACA 1096