EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-17237 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:26211998-26213137 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr18:26212218-26212237TCACCACAAGAGGTCGCCA+6.09
FOXF2MA0030.1chr18:26213053-26213067TCATGGTAAACAAT+6.14
IRF1MA0050.2chr18:26212762-26212783ATAAAGAAAAAAAAAGTAAAA-6.07
RFX1MA0509.2chr18:26212135-26212151CGTTGTCATGGTGACA+6.5
RFX1MA0509.2chr18:26212135-26212151CGTTGTCATGGTGACA-6.5
RFX2MA0600.2chr18:26212135-26212151CGTTGTCATGGTGACA-6.14
RFX2MA0600.2chr18:26212135-26212151CGTTGTCATGGTGACA+6.2
RFX3MA0798.1chr18:26212746-26212762CGTTTCTATGGTTACA-6.13
RFX3MA0798.1chr18:26212135-26212151CGTTGTCATGGTGACA-6.3
RFX4MA0799.1chr18:26212746-26212762CGTTTCTATGGTTACA+6.15
RFX4MA0799.1chr18:26212135-26212151CGTTGTCATGGTGACA-6.36
ZNF384MA1125.1chr18:26212079-26212091TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr18:26212081-26212093TTTTTTTTTAGA-6.52
Enhancer Sequence
TTAGCCGTTT TTAATTAATT CATTTCATAT TCATCTCTCT AACCCCATTT ATATCATAAT 60
GTTACCCCTC CTCTCAATAC ATTTTTTTTT TTAGATGATT ACCATTTCCC AGCGCTTTAA 120
GATTTTTCTT AGCTTTTCGT TGTCATGGTG ACAGGTCTCT ATGCTTGCAT CTATAATTAA 180
GACAATGAAT TATTCTTGAT ATCAGTTTTA TCTATCAACA TCACCACAAG AGGTCGCCAT 240
CCAACCTGTG AATAACTGAT GAAAACCGTG AGTTCAGTTT GTTTGCTCTT TAATATTTTT 300
CCTAATTAAT CAGATAACTT TACGTCTTCT GGCTCTGTAA TATCATGATA GGCTATTATT 360
TTTATATTTT ACTTTTAATT TGGACTTCAA CTACTTCATC AGGCTACGTC AACGTGCAAA 420
TTGCAAAGTT GCAAATTATC TACCTACGCA CGGCTGTGAC GTAAGCCTGT TAGCTGTTTT 480
GAAGTTGCTA TTTCGTTGTG TCTCGTCGTC TAAATCAAAT TACAAGAAAG TGAAATTAAG 540
AGTAAATTCA GATTATTAAT CTTATTAACT GTGCCTGGGT CTGTACATGT AGCTACAGTT 600
TACCCTCTCA TACACGCGTC CCTTGTTCGT TGTTGAGTGA TAAAGCATTT GTTTATTACA 660
TTAACGTTAA GTCTGTAACC TATGGAGAGC GTGAGACCGA ACAAACTTAA AATCATATAG 720
ACATCATCAT CATCATCATC AGTAAAATCG TTTCTATGGT TACAATAAAG AAAAAAAAAG 780
TAAAATCATC CAACAGTTTG GGAGTTATTC CAGCTAAAAG TGCCACACGT GTTGTAAGTA 840
CACAATGCTT TAGAGGTAAA GTTGGTTTTA TATAAGCACA TTCAGACTTT CTCCTTAATA 900
ATATATTTTC ATAAAAGTAT AATTTGCTAA CTCTATAGCG AAGTCATATT AGCGGCCAAC 960
GACTATCAAA GTACATTGTT CACAGTCAAA TAAACAGTGT TAATGTTGTT TTCAAGTCAT 1020
ACTTGCCTGC TAATTCCGAT CGAATATTCA AAGTGTCATG GTAAACAATA TAAACTTCTA 1080
AATGAACGAA TGTGCGAATA AAAAAAACAA CTTTACCTCT ATCACAATGC CACACACAA 1139